More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0254 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  92.76 
 
 		 388 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 388 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  75.65 
 
 		 388 aa  615  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  74.48 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  59.54 
 
 		 388 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  58.06 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  50.77 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  47.69 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  46.95 
 
 		 401 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  42.63 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  42.86 
 
 		 395 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  40.67 
 
 		 406 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  44.27 
 
 		 388 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  41.51 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  41.11 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  42.13 
 
 		 385 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  40 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  41.73 
 
 		 400 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  41.51 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  40.87 
 
 		 400 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  41.41 
 
 		 400 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  41.3 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  40.43 
 
 		 403 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  41.85 
 
 		 410 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  40.32 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  40.37 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  40.92 
 
 		 400 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  40.92 
 
 		 400 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  40.11 
 
 		 408 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  39.32 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  40.32 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  40.32 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  38.37 
 
 		 381 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  32.29 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  32.22 
 
 		 386 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  35.93 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  32.14 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  35.28 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  32.44 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  31.93 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  31.5 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  35.2 
 
 		 393 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  35.39 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  30.68 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  31.87 
 
 		 392 aa  186  4e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  35.14 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  32.62 
 
 		 390 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  30.05 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  31.74 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  33.6 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  33.61 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  34.36 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  33.89 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  31.23 
 
 		 396 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  30.99 
 
 		 386 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  31 
 
 		 375 aa  182  8.000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 		 377 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  30.03 
 
 		 377 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  32.56 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  30.26 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  30.18 
 
 		 396 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.45 
 
 		 396 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.18 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  31.04 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  29.27 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  31.3 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  31.2 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  28.5 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  32.75 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  29.78 
 
 		 385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  33.24 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  29.27 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.45 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30.18 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  30.32 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  33.03 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  31.23 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  29.78 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  29.02 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  29.78 
 
 		 387 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  29.78 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  28.94 
 
 		 390 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  30.85 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  29.23 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  29.78 
 
 		 387 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  31.59 
 
 		 392 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0207  aspartate aminotransferase  34.17 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  29.92 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  29.92 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  29.92 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  30.21 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  29.92 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  31.59 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  30.99 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  29.2 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  30.03 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  27.63 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>