More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0624 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 395 aa  805    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  74.94 
 
 		 388 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  74.48 
 
 		 388 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  70.13 
 
 		 388 aa  577  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  58.76 
 
 		 388 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  56.79 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  48.08 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  45.82 
 
 		 401 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  45.86 
 
 		 403 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  44.41 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  43.01 
 
 		 406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  41.82 
 
 		 399 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  41.45 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  42.7 
 
 		 400 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  41.78 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  41.99 
 
 		 408 aa  292  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  42.67 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  42.74 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  42.7 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  42.7 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 		 400 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  40.69 
 
 		 385 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  42.36 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  42.13 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  42.13 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  41.87 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 		 400 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  41.87 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  40.27 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  38.1 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  38.1 
 
 		 402 aa  256  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  39.37 
 
 		 384 aa  256  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  39.88 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  34.51 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  32.38 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  31.69 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  29.65 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  35.93 
 
 		 393 aa  192  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  32.15 
 
 		 395 aa  193  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  33.16 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  31.68 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  32.88 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  33.78 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  31.82 
 
 		 444 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  31.17 
 
 		 377 aa  189  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  31.17 
 
 		 377 aa  189  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  32.15 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  32.87 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  32.13 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  33.15 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  31.32 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 		 375 aa  186  7e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  33.99 
 
 		 392 aa  186  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  32.11 
 
 		 393 aa  185  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  30.32 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  32.12 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  30.15 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  32.12 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  30.14 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  34.59 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  32.31 
 
 		 397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  29.95 
 
 		 379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  32.28 
 
 		 380 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  35.2 
 
 		 392 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  31.78 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0207  aspartate aminotransferase  33.6 
 
 		 376 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  34.33 
 
 		 397 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  31.63 
 
 		 387 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  32.73 
 
 		 392 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  30.4 
 
 		 402 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  32.48 
 
 		 402 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  31.17 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  34.23 
 
 		 390 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  33.62 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  30.31 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  30.75 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  31.55 
 
 		 393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  32.56 
 
 		 402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  31.65 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  30.51 
 
 		 393 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  32.07 
 
 		 401 aa  180  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  30.39 
 
 		 386 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  31.68 
 
 		 400 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 376 aa  179  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.37 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  29.89 
 
 		 373 aa  179  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  31.93 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  31.68 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  29.62 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  33.07 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  31.94 
 
 		 388 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  34.99 
 
 		 415 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  31.49 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  33.72 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  31.49 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  31.41 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  29.62 
 
 		 429 aa  176  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>