More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7544 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  83.25 
 
 		 401 aa  661    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 403 aa  794    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  52.97 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  57.64 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  50.39 
 
 		 388 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  47.69 
 
 		 388 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  48.21 
 
 		 388 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  48.79 
 
 		 388 aa  345  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  45.86 
 
 		 395 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  47.61 
 
 		 398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  47.77 
 
 		 406 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  46.1 
 
 		 400 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  45.36 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  45.71 
 
 		 400 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  44.58 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  46.49 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  45.41 
 
 		 400 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  45.41 
 
 		 400 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 		 399 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  42.31 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  43.73 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  41.18 
 
 		 385 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  42.25 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  43.2 
 
 		 388 aa  269  8e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  39.45 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  42.11 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  43.31 
 
 		 388 aa  265  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  42.04 
 
 		 402 aa  262  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  42.04 
 
 		 402 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  40.73 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  41.3 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  34.81 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  34.86 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  33.93 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  38.38 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  31.51 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 		 402 aa  216  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  36.6 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  35.34 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  32.99 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  34.91 
 
 		 387 aa  212  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  37.94 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  39.3 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  32.28 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  31.73 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  37.09 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  33.33 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  34.52 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  40.63 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  36.99 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  32.04 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  32.99 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 387 aa  209  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  35.32 
 
 		 405 aa  209  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  33.85 
 
 		 404 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  37.43 
 
 		 393 aa  209  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  31.94 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  31.76 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  30.96 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  32.02 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  35.52 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  36.54 
 
 		 397 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  32.18 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  32.18 
 
 		 392 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  31.76 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  35.31 
 
 		 392 aa  207  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  31.41 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  33.7 
 
 		 392 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  31.5 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  31.5 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  31.5 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  31.5 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  37.16 
 
 		 392 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  34.43 
 
 		 379 aa  206  6e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  32.93 
 
 		 398 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  34.45 
 
 		 401 aa  206  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  34.44 
 
 		 392 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  34.4 
 
 		 417 aa  206  7e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  33.83 
 
 		 397 aa  206  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  36.78 
 
 		 387 aa  206  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  31.5 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  37.06 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  34.18 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  32.9 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  33.16 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  34.1 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  38.04 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  30.89 
 
 		 392 aa  204  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  31.75 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  30.46 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  30.46 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2610  aminotransferase class I and II  37.53 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.436935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  30.71 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  35.39 
 
 		 392 aa  203  6e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  36.87 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  30.08 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  36.57 
 
 		 444 aa  202  7e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>