More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1377 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  85.04 
 
 		 402 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  99 
 
 		 400 aa  787    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  89 
 
 		 400 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 400 aa  796    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  89 
 
 		 400 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  89 
 
 		 400 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  74.16 
 
 		 395 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  71.14 
 
 		 408 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  70.4 
 
 		 408 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  70.68 
 
 		 399 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  72.09 
 
 		 410 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  70.54 
 
 		 403 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  59.22 
 
 		 388 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  57.4 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  58.16 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  59.42 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  56.92 
 
 		 385 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  59.16 
 
 		 402 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  55.09 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  56.02 
 
 		 384 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  53.54 
 
 		 385 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  45.92 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  46.94 
 
 		 401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  46.59 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  43.51 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  44.19 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  40.41 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  42.01 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  42.19 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  41.16 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  42.93 
 
 		 427 aa  285  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  42.26 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  39.19 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  41.13 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  36.12 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  35.88 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  35.08 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  32.73 
 
 		 390 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 		 392 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  32.54 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 392 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  35.13 
 
 		 392 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  34.83 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  31.11 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  34.03 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  35.9 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  31.2 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  35.54 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 386 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  35 
 
 		 393 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  37.04 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  32.54 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  36.19 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  33.69 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 		 397 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  33.68 
 
 		 397 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  33.68 
 
 		 392 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  33.68 
 
 		 392 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  37.36 
 
 		 384 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.81 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  33.98 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  31.2 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  33.93 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  32.9 
 
 		 390 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 		 402 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  32.93 
 
 		 400 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  35.71 
 
 		 385 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  31.56 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  30.81 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  31.44 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  32.03 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  37.06 
 
 		 393 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  30.81 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  30.81 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  30.45 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.83 
 
 		 396 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30.45 
 
 		 396 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  34.89 
 
 		 400 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  34.9 
 
 		 417 aa  190  5e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.45 
 
 		 396 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  34.66 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  30.55 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  32.22 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.45 
 
 		 396 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  33.95 
 
 		 376 aa  189  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  30.55 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  34.84 
 
 		 382 aa  189  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  30.18 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  30.18 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  30.18 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  34.43 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  30.18 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.52 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  32.89 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  30.55 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  33.61 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>