More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1397 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 388 aa  768    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  72.16 
 
 		 388 aa  565  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  69.43 
 
 		 385 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  68.42 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  67.7 
 
 		 384 aa  519  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  65.72 
 
 		 390 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  64.94 
 
 		 385 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  60.21 
 
 		 395 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  59.16 
 
 		 403 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  58.25 
 
 		 408 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  58.44 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  57.07 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  57.99 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  59.48 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  58.44 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  58.96 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  59.22 
 
 		 400 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  58.44 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  58.44 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  54.71 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  54.71 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  42.97 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  41.41 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  41.87 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  40.85 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  41.64 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  43.12 
 
 		 398 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  41.51 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  44.56 
 
 		 401 aa  279  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  42.08 
 
 		 410 aa  276  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  44.3 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  41.99 
 
 		 406 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  40.83 
 
 		 381 aa  229  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  35.5 
 
 		 412 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  34.38 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  32.29 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  32.88 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  33.61 
 
 		 392 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 		 393 aa  189  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  30.81 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  31.7 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  31.7 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  31.03 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.3 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  31.25 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  33.61 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  31.77 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  32.46 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  34.77 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  31.61 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  33.79 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  33.04 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.69 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  31.71 
 
 		 400 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  29.62 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  29.87 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  29.95 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  29.69 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  31.86 
 
 		 392 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  31.71 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  35.97 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  31.61 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  29.79 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  30.08 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  30.36 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  32.65 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  34.8 
 
 		 409 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  30 
 
 		 392 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  31.62 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  30.57 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  35.09 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  26.94 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  34.12 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  30.49 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  27.94 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  29.76 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  30.59 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  29.23 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  31.51 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  32.04 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  28.96 
 
 		 429 aa  169  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 397 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  29.97 
 
 		 388 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  32.65 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  28.73 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 		 380 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  30.26 
 
 		 385 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  29.05 
 
 		 397 aa  169  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  30.59 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  30.59 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  30.26 
 
 		 402 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  30.03 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  30.26 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  29.48 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  30 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  30.66 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  29.97 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  26.37 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  30.71 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>