More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1495 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 388 aa  779    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  72.16 
 
 		 388 aa  555  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  66.67 
 
 		 395 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  67.8 
 
 		 385 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  67.62 
 
 		 385 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  65.46 
 
 		 390 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  65.63 
 
 		 384 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  55.81 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  56.69 
 
 		 403 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  55.91 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  56.88 
 
 		 400 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  57.66 
 
 		 402 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  54.9 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  55.38 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  56.1 
 
 		 400 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  55.41 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  57.4 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  56.1 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  56.1 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  54.55 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  54.03 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  44.27 
 
 		 388 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  44.8 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  43.24 
 
 		 388 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  42.13 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  41.04 
 
 		 388 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  42.97 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  41.21 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  43.31 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  40.91 
 
 		 427 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  40.78 
 
 		 406 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  41.86 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  41.98 
 
 		 381 aa  236  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  34.28 
 
 		 412 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.51 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  32.53 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  36.14 
 
 		 392 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  31.61 
 
 		 392 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  31.62 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  31.99 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  34.9 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  30.79 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  32.69 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  31.61 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  32.34 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  34.19 
 
 		 393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  34.42 
 
 		 397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  29.67 
 
 		 390 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  30.22 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  30.43 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.29 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  34.44 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  31.07 
 
 		 370 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  30.95 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  28.05 
 
 		 375 aa  179  8e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  31.15 
 
 		 398 aa  179  9e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  37.09 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  31.01 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  31.01 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  31.88 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  30.87 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  29.6 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  28.98 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  32.6 
 
 		 382 aa  177  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  30.79 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  30.87 
 
 		 388 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  32.32 
 
 		 392 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  30.49 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.61 
 
 		 404 aa  176  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  30.57 
 
 		 395 aa  176  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  30.75 
 
 		 387 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  30.75 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  30.75 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  31.46 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  30.69 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  30.49 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  30.23 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  32.2 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  33.51 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  30.49 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  33.15 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  33.53 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  30.49 
 
 		 377 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30.49 
 
 		 377 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  35.41 
 
 		 386 aa  172  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  30.37 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  26.85 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  30.52 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  31.75 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  30.34 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  33.9 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 		 410 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  30.25 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  29.58 
 
 		 374 aa  169  7e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  30.25 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  29.77 
 
 		 396 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  31.73 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  31.9 
 
 		 400 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  30.11 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>