More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3516 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 385 aa  782    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  76.9 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  72.28 
 
 		 390 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  71.73 
 
 		 385 aa  571  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  73.75 
 
 		 384 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  67.8 
 
 		 388 aa  539  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  69.43 
 
 		 388 aa  534  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  58.07 
 
 		 410 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  59.32 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  55.87 
 
 		 399 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  55.81 
 
 		 403 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  55.9 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  56.14 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  54.99 
 
 		 408 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  56.66 
 
 		 402 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  56.66 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  56.4 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  56.4 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  55.47 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  56.92 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  54.95 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  45.43 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  40.1 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  40 
 
 		 388 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  40.69 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  42.6 
 
 		 406 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  39.14 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  39.36 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  42.09 
 
 		 401 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  42.11 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  39.58 
 
 		 427 aa  262  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  39.38 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  39.2 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  37.64 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  34.29 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  31.42 
 
 		 387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  32.58 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  30.85 
 
 		 392 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  30.59 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  32.56 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  31.59 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  35.31 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  30.45 
 
 		 401 aa  187  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  34.72 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  34.07 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  30.99 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  30.83 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  34.79 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  30.83 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  31.09 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  31.09 
 
 		 387 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  31.09 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  31.39 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  32.97 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  30.63 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  32.14 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  31.38 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  33.94 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  34.67 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  31.42 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  30.83 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  31.88 
 
 		 377 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  30.83 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  31.56 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  31.88 
 
 		 377 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  32.22 
 
 		 393 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  31.17 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  30.57 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  31.36 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  29.61 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  30.83 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  29.97 
 
 		 388 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  30.42 
 
 		 390 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  27.56 
 
 		 375 aa  179  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  30.03 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  30.13 
 
 		 397 aa  179  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  30.98 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  29.27 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  30.55 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  29.65 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 		 379 aa  177  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  30.53 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  32.52 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  31.11 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  31.79 
 
 		 393 aa  176  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  30.21 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  33.52 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  31.36 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  29.23 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  29.95 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  31.17 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  32.78 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  33.53 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  31.13 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  33.06 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>