More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1257 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  100 
 
 
390 aa  788    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  72.28 
 
 
385 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  73.37 
 
 
385 aa  581  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  69.54 
 
 
395 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  70.16 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  65.46 
 
 
388 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  65.46 
 
 
388 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  55.32 
 
 
395 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  55.38 
 
 
403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  53.52 
 
 
399 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  54.38 
 
 
410 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  55.7 
 
 
402 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  54.38 
 
 
402 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  54.24 
 
 
400 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  54.83 
 
 
400 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  53.87 
 
 
402 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  54.92 
 
 
400 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  54.92 
 
 
400 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  55.09 
 
 
400 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  51.79 
 
 
408 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  51.79 
 
 
408 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  41.45 
 
 
395 aa  296  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  41.11 
 
 
388 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  42.82 
 
 
398 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  41.87 
 
 
388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  41.07 
 
 
388 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  43.73 
 
 
403 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  42.59 
 
 
406 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  39.12 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  42.01 
 
 
427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  43.16 
 
 
401 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  39.69 
 
 
410 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  39.47 
 
 
381 aa  222  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  37.02 
 
 
412 aa  212  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.81 
 
 
444 aa  200  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  32.47 
 
 
396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1423  aminotransferase  34.41 
 
 
384 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  31.45 
 
 
375 aa  195  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  30.05 
 
 
401 aa  194  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  32.25 
 
 
392 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  33.87 
 
 
391 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  29.2 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  34.62 
 
 
393 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  34.77 
 
 
387 aa  189  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  32.1 
 
 
391 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  32.64 
 
 
395 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  34.81 
 
 
409 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  31.19 
 
 
390 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  29.87 
 
 
395 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  33.89 
 
 
395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  33.06 
 
 
389 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  30.16 
 
 
390 aa  182  8.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  32.01 
 
 
391 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  31.44 
 
 
398 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  31.97 
 
 
387 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  30.11 
 
 
399 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  30.05 
 
 
408 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  34.08 
 
 
384 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  30.37 
 
 
380 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  30.45 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  31.51 
 
 
387 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  31.43 
 
 
388 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  32.53 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 
389 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  34.16 
 
 
397 aa  179  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  29.61 
 
 
390 aa  179  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  29.4 
 
 
396 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.02 
 
 
404 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  31.22 
 
 
392 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  31.22 
 
 
392 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  29.9 
 
 
401 aa  177  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  31.17 
 
 
387 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  31.17 
 
 
387 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  31.69 
 
 
392 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  27.75 
 
 
375 aa  176  6e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  35.1 
 
 
396 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  30.99 
 
 
387 aa  176  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  30.73 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  31.13 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  29.17 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  30.57 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  31.17 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  30.91 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  31.56 
 
 
385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  30.52 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  30.91 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  31.76 
 
 
393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  28.35 
 
 
402 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  34.3 
 
 
380 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 
381 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1382  aminotransferase  30.19 
 
 
397 aa  172  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
411 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  30.73 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  28.95 
 
 
387 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  35 
 
 
396 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  29.67 
 
 
397 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  29.43 
 
 
393 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  31.96 
 
 
400 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  34.51 
 
 
396 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
402 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>