More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1627 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  92.16 
 
 
408 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  81.25 
 
 
410 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  100 
 
 
408 aa  825    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  73.21 
 
 
399 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  74.23 
 
 
395 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  72.54 
 
 
403 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  71.25 
 
 
400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  72.29 
 
 
402 aa  567  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  71.07 
 
 
400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  71.25 
 
 
400 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  71.25 
 
 
400 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  71.32 
 
 
400 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  58.51 
 
 
388 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  55.93 
 
 
388 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  55.9 
 
 
385 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  55.89 
 
 
395 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  55.41 
 
 
384 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  55.88 
 
 
402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  53.87 
 
 
385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  55.39 
 
 
402 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  51.79 
 
 
390 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  42.67 
 
 
395 aa  302  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  41.27 
 
 
427 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  39.85 
 
 
388 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  41.58 
 
 
406 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  41.24 
 
 
398 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  40.11 
 
 
388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  40.15 
 
 
410 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  40.37 
 
 
388 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  41.29 
 
 
401 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  40.37 
 
 
388 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  40.2 
 
 
403 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  34.26 
 
 
412 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  32.75 
 
 
390 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  34.96 
 
 
386 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  35.18 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  31.71 
 
 
392 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  31.46 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  38.44 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  32.65 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  36.31 
 
 
397 aa  196  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  30.2 
 
 
387 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  30.2 
 
 
387 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  32.49 
 
 
386 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.65 
 
 
404 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  32.97 
 
 
390 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  30.69 
 
 
388 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  33.42 
 
 
393 aa  193  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  32.57 
 
 
391 aa  193  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 
393 aa  193  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  29.95 
 
 
387 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  35.25 
 
 
388 aa  192  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  29.85 
 
 
385 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  29.95 
 
 
387 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  30.54 
 
 
388 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  29.95 
 
 
387 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  35.46 
 
 
382 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  29.7 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  32.88 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  32.74 
 
 
390 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  29.44 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.77 
 
 
396 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  32.4 
 
 
401 aa  188  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  32.33 
 
 
392 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  29.19 
 
 
387 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  28.22 
 
 
387 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  29.44 
 
 
387 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  33.15 
 
 
387 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  31.25 
 
 
391 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  33.97 
 
 
393 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  31.85 
 
 
392 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  30.59 
 
 
387 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  33.33 
 
 
444 aa  186  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  30.54 
 
 
375 aa  186  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  34.97 
 
 
384 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  33.78 
 
 
392 aa  186  6e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  32.56 
 
 
405 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  34.79 
 
 
381 aa  186  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  32.55 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30 
 
 
396 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  34.46 
 
 
379 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  29.59 
 
 
386 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  28.39 
 
 
387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  29.74 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  29.74 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  29.74 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  29.74 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  30 
 
 
390 aa  182  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  31.58 
 
 
379 aa  182  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  31.42 
 
 
388 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  34.41 
 
 
396 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  31.42 
 
 
370 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  29.82 
 
 
396 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  31.12 
 
 
399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  34.2 
 
 
367 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  30.47 
 
 
392 aa  180  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>