More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3209 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  100 
 
 
410 aa  833    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  57.25 
 
 
427 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  52.06 
 
 
388 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  53.61 
 
 
388 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  52.97 
 
 
403 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  51.55 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  52.75 
 
 
401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  50.77 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  48.08 
 
 
395 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  45.97 
 
 
398 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  46.32 
 
 
406 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  39.46 
 
 
399 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  42.52 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  42.26 
 
 
402 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  41.36 
 
 
395 aa  279  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  42.26 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  42.26 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  42.3 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  42.3 
 
 
400 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  39.9 
 
 
410 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  41.56 
 
 
388 aa  269  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  40.15 
 
 
408 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  39.13 
 
 
408 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  40.31 
 
 
403 aa  262  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  39.69 
 
 
390 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  39.38 
 
 
385 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  41.86 
 
 
388 aa  257  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  37.5 
 
 
385 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  39.8 
 
 
395 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  38.22 
 
 
402 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  38.22 
 
 
402 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  36.84 
 
 
412 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  34.43 
 
 
404 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  34.01 
 
 
399 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  35.99 
 
 
381 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  32.55 
 
 
388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  33.68 
 
 
387 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  33.68 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  34.33 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  32.7 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  33.68 
 
 
387 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  33.68 
 
 
387 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  32.99 
 
 
390 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  32.82 
 
 
387 aa  197  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  34.79 
 
 
388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 
388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  33.68 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  33.5 
 
 
387 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  33.68 
 
 
387 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  34.19 
 
 
400 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  33.42 
 
 
387 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  32.91 
 
 
393 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  31.59 
 
 
396 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  32.23 
 
 
386 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  31.61 
 
 
387 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  33.5 
 
 
393 aa  193  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  32.64 
 
 
387 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  33.16 
 
 
390 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  35.05 
 
 
391 aa  192  8e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  31.85 
 
 
388 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  32.2 
 
 
387 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  31.82 
 
 
386 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  30.55 
 
 
396 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  32.81 
 
 
387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.29 
 
 
396 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.29 
 
 
396 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  31.25 
 
 
382 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  32.59 
 
 
402 aa  189  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  35.08 
 
 
393 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  30.03 
 
 
396 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  30.03 
 
 
396 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.29 
 
 
396 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  34.38 
 
 
392 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  30.03 
 
 
396 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  30.98 
 
 
375 aa  189  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  30.31 
 
 
396 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  30.03 
 
 
396 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  31.13 
 
 
385 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30.03 
 
 
396 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  31.12 
 
 
387 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  33.51 
 
 
377 aa  187  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 
377 aa  187  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  32.88 
 
 
379 aa  186  9e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  29.64 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  29.64 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  32.31 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  33.06 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  30.32 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  31.76 
 
 
393 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  31.52 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  35.2 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 
429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  32.35 
 
 
393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  31.44 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  31.83 
 
 
397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 
417 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  30.99 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  32.49 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  33.6 
 
 
411 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>