More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0167 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 388 aa  786    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  77.32 
 
 		 388 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  75.65 
 
 		 388 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  70.13 
 
 		 395 aa  577  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  61.56 
 
 		 388 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  59.51 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  51.55 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  50.39 
 
 		 403 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  49.35 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  43.04 
 
 		 398 aa  315  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  41.09 
 
 		 406 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  43.13 
 
 		 395 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  43.09 
 
 		 400 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  43.9 
 
 		 402 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  41.87 
 
 		 390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  43.24 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  43.24 
 
 		 388 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  42.44 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  43.51 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  42.47 
 
 		 410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  40.7 
 
 		 399 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  41.18 
 
 		 385 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  39.14 
 
 		 385 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  40.31 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  40.62 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  40.37 
 
 		 408 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  41.4 
 
 		 402 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  41.13 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  38.06 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  39.09 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  32.62 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  35.38 
 
 		 412 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  32.77 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  29.32 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  31.02 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  32.03 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  31.61 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  31.61 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  32.45 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  32.46 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  36.18 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  34.38 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  30.21 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  29.92 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  30.81 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.47 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  32.82 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  33.94 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  31.87 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.25 
 
 		 404 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  30.21 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  29.46 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  31.87 
 
 		 390 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  34.93 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  31.04 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  34.07 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  31.52 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  32.32 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  30.89 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  29.95 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  33.08 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  30.83 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  34.97 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  34.72 
 
 		 390 aa  183  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  31.03 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  31.53 
 
 		 400 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  31.17 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  31.3 
 
 		 393 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  29.95 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  32.97 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  29.74 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  35.47 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  29.69 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  31.52 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  33.33 
 
 		 393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  33.42 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  29.69 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  29.69 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  30.64 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  32.51 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  28.68 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  29.69 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  31.5 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  30.79 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  32.54 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  32.87 
 
 		 393 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2610  aminotransferase class I and II  32.88 
 
 		 393 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.436935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  34.63 
 
 		 415 aa  180  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.21 
 
 		 396 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  30.27 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  29.95 
 
 		 396 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  29.95 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  29.69 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>