More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2062 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  100 
 
 
374 aa  749    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1518  aminotransferase class I and II  76.42 
 
 
374 aa  581  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.489896 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  66.76 
 
 
375 aa  474  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  41.4 
 
 
387 aa  262  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  41.71 
 
 
397 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  43.2 
 
 
394 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10257  predicted protein  37.87 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.144929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  42.26 
 
 
391 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  41.07 
 
 
409 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  42.2 
 
 
387 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.67 
 
 
387 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  43.01 
 
 
387 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  42.51 
 
 
382 aa  235  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  40.63 
 
 
389 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  42.08 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  39.67 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  41.95 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  37.87 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.54 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.73 
 
 
402 aa  233  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  40.21 
 
 
401 aa  232  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  39.06 
 
 
393 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  39.37 
 
 
391 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  40.75 
 
 
389 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  38.68 
 
 
393 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  38.72 
 
 
384 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  38.17 
 
 
382 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  38.01 
 
 
384 aa  229  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  40.94 
 
 
397 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  40.53 
 
 
381 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  39.95 
 
 
383 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  38.83 
 
 
384 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  39.36 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  41.21 
 
 
397 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  37.63 
 
 
382 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0118  putative aminotransferase  38.56 
 
 
384 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  38.71 
 
 
388 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  40.92 
 
 
397 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0109  putative aminotransferase  38.3 
 
 
384 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  37.74 
 
 
386 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  40.7 
 
 
389 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3299  putative aminotransferase  38.3 
 
 
384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  37.53 
 
 
382 aa  222  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  40.37 
 
 
389 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  40.37 
 
 
389 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  39.47 
 
 
395 aa  222  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  36.86 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 
400 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.59 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2936  putative aminotransferase  38.03 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  38.03 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  39.26 
 
 
392 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0220  aminotransferase class I and II  37.1 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  35.75 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  38.62 
 
 
394 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  36.02 
 
 
382 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  36.02 
 
 
382 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  39.2 
 
 
391 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  36.83 
 
 
382 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0133  putative aminotransferase  37.5 
 
 
384 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  38.8 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  35.2 
 
 
382 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  38.9 
 
 
409 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.85 
 
 
408 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.26 
 
 
413 aa  216  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  39.79 
 
 
402 aa  216  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  37.63 
 
 
384 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  36.83 
 
 
384 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  42.22 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  36.39 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  36.02 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  35.48 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  38.1 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  37.7 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  36.97 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  35.75 
 
 
384 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  37.1 
 
 
383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  39.9 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  39.19 
 
 
384 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  36.29 
 
 
385 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  37.07 
 
 
390 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  38.81 
 
 
384 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  40.86 
 
 
388 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  39.57 
 
 
398 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  37.08 
 
 
421 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  34.95 
 
 
390 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  34.77 
 
 
382 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  35.75 
 
 
390 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  37.33 
 
 
390 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  35.22 
 
 
385 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  34.12 
 
 
390 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00190  aminotransferase, putative  32.38 
 
 
460 aa  207  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00967249  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  34.95 
 
 
390 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 
393 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  37.07 
 
 
391 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  37.07 
 
 
391 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  37.07 
 
 
391 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  37.07 
 
 
384 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  38.71 
 
 
384 aa  205  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  35.39 
 
 
389 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>