More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1417 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 400 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  88.69 
 
 		 400 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  99 
 
 		 400 aa  787    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  88.69 
 
 		 400 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  84.29 
 
 		 402 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  88.69 
 
 		 400 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  73.9 
 
 		 395 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  70.82 
 
 		 408 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  70.4 
 
 		 408 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  70.94 
 
 		 399 aa  552  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  72.35 
 
 		 410 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  70.28 
 
 		 403 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  59.48 
 
 		 388 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  56.88 
 
 		 388 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  58.9 
 
 		 402 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  57.65 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  56.66 
 
 		 385 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  58.64 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  55.76 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  54.83 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  53.28 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  45.15 
 
 		 403 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  46.17 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  46.59 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  44.19 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  43.24 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  40.41 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  41.69 
 
 		 388 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  41.16 
 
 		 388 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  41.93 
 
 		 388 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  42.67 
 
 		 427 aa  282  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  42.26 
 
 		 410 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  38.68 
 
 		 412 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  37 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  40.86 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  35.79 
 
 		 404 aa  213  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  36.77 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  36.41 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  32.54 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  32.47 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  35.32 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  33.07 
 
 		 392 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  34.2 
 
 		 386 aa  206  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  32.81 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  31.11 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  34.03 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  35.32 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  34.57 
 
 		 393 aa  203  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  34.55 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  34.87 
 
 		 392 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  30.92 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  32.54 
 
 		 391 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  32.55 
 
 		 390 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  33.68 
 
 		 397 aa  196  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  33.68 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  34.21 
 
 		 376 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  31.94 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  33.68 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  36.75 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  35.91 
 
 		 402 aa  192  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  34.44 
 
 		 384 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  31.7 
 
 		 388 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  35.53 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  32.93 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.55 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  32.9 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  35.16 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  35.81 
 
 		 397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  30.81 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  34.47 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  36.52 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  31.76 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  30.81 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  35.45 
 
 		 385 aa  189  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  30.81 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  36.78 
 
 		 393 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  30.45 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  31.93 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.26 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  30.55 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  30.55 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  34.9 
 
 		 417 aa  186  5e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  30.5 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  32.89 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30.18 
 
 		 396 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  33.24 
 
 		 396 aa  186  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  30.55 
 
 		 387 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.57 
 
 		 396 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.18 
 
 		 396 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.18 
 
 		 396 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  30.29 
 
 		 387 aa  186  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  29.9 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  31.94 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  29.92 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  30.29 
 
 		 387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  34.46 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>