More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0664 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  793    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  59.41 
 
 
390 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  59.53 
 
 
400 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  59.41 
 
 
390 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  58.6 
 
 
393 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  58.6 
 
 
390 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  59.14 
 
 
390 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  58.76 
 
 
388 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  59.14 
 
 
390 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  55.24 
 
 
385 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  57.53 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  58.06 
 
 
390 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  55.76 
 
 
394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  57.26 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  56.99 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  57.26 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  53.4 
 
 
394 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  51.79 
 
 
398 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  51.93 
 
 
397 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  47.66 
 
 
393 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  50.26 
 
 
397 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  51.28 
 
 
398 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  50 
 
 
394 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  50 
 
 
394 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  46.88 
 
 
393 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  50 
 
 
398 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  52.88 
 
 
389 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  48.7 
 
 
394 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  51.04 
 
 
398 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  50.78 
 
 
398 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  50.78 
 
 
398 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  50.52 
 
 
398 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  50.26 
 
 
398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  50 
 
 
414 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  50.26 
 
 
397 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  50.26 
 
 
397 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  50.26 
 
 
397 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  50.26 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  50.26 
 
 
460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  48.71 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  50.26 
 
 
397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  50.26 
 
 
397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  47.26 
 
 
388 aa  352  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  50.66 
 
 
400 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  47.69 
 
 
394 aa  336  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  47.44 
 
 
394 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  47.26 
 
 
394 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  44.56 
 
 
396 aa  330  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  47.17 
 
 
400 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  46.41 
 
 
398 aa  322  7e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  45.32 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  44.39 
 
 
381 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  42.97 
 
 
394 aa  319  7e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  46.15 
 
 
393 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  43.73 
 
 
396 aa  312  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  45.03 
 
 
383 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  45.76 
 
 
398 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  43.37 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  43.19 
 
 
383 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  41.13 
 
 
381 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  43.46 
 
 
383 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  42.02 
 
 
381 aa  296  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  43.19 
 
 
378 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  43.62 
 
 
391 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  42.45 
 
 
387 aa  292  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  41.99 
 
 
387 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  40.51 
 
 
410 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  42.19 
 
 
387 aa  289  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  40.26 
 
 
376 aa  288  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  43.01 
 
 
406 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  41.38 
 
 
385 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  39.11 
 
 
383 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 
412 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  40.83 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  39.74 
 
 
381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  41.47 
 
 
393 aa  282  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  41.6 
 
 
387 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  38.02 
 
 
384 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  41.6 
 
 
387 aa  280  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  41.11 
 
 
395 aa  280  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  38.02 
 
 
379 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  41.32 
 
 
390 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  41.11 
 
 
388 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  40.37 
 
 
365 aa  276  3e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  41.51 
 
 
387 aa  275  8e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  39.42 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  39.07 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  41.38 
 
 
395 aa  272  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  42.48 
 
 
396 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  39.9 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  35.86 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  41.8 
 
 
399 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  38.03 
 
 
384 aa  269  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  39.13 
 
 
407 aa  268  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  37.86 
 
 
384 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  41.87 
 
 
395 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  41.53 
 
 
395 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  39.27 
 
 
392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 
384 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  41.1 
 
 
390 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>