More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3082 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3082  aspartate aminotransferase  100 
 
 
406 aa  813    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.410031 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3437  aspartate aminotransferase  99.01 
 
 
406 aa  805    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3422  aspartate aminotransferase  77.37 
 
 
410 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2060  aspartate aminotransferase  93.1 
 
 
405 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9152  aspartate aminotransferase  68.56 
 
 
409 aa  558  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  27.3 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  27.45 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  29.75 
 
 
373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  28.74 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  22.46 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  28.93 
 
 
396 aa  116  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  29.2 
 
 
385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  25.94 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  28.37 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  27.84 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  25.66 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  26.22 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  24.93 
 
 
392 aa  113  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  24.59 
 
 
400 aa  113  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  24.93 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  23.91 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  28.41 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  30.23 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  25.58 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  23.93 
 
 
375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  28.74 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  27.78 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  29.46 
 
 
385 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  24.19 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  26.2 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  26.21 
 
 
395 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  25.93 
 
 
395 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  25.93 
 
 
395 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  25.93 
 
 
395 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  25.93 
 
 
395 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  25.93 
 
 
395 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  25.81 
 
 
386 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  26.61 
 
 
396 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  26.61 
 
 
396 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  24.64 
 
 
408 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  29.38 
 
 
369 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  27.54 
 
 
394 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  27.05 
 
 
399 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  28.33 
 
 
393 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  25.43 
 
 
393 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  26.21 
 
 
389 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  29.09 
 
 
387 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  27.19 
 
 
382 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  28.76 
 
 
389 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  25.64 
 
 
395 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  29.7 
 
 
393 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  25.68 
 
 
393 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  26.32 
 
 
396 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  30.84 
 
 
390 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  25.64 
 
 
395 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  25.36 
 
 
395 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  25.65 
 
 
396 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  27.78 
 
 
382 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  27.78 
 
 
382 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  28.49 
 
 
367 aa  106  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 
405 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  26.27 
 
 
399 aa  106  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  25.81 
 
 
396 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  29.67 
 
 
400 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  26.04 
 
 
379 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  24.53 
 
 
393 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  25.35 
 
 
402 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  25.98 
 
 
395 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  25.62 
 
 
387 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  25.71 
 
 
395 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  27.41 
 
 
417 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  27.85 
 
 
409 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  27.63 
 
 
389 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  27.25 
 
 
382 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  25.54 
 
 
389 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  29.01 
 
 
373 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  26.4 
 
 
401 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  27.11 
 
 
390 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  29.2 
 
 
393 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  21.35 
 
 
375 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  25.07 
 
 
395 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  23.04 
 
 
385 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  27.73 
 
 
385 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  22.16 
 
 
375 aa  103  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  25.07 
 
 
389 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  26.73 
 
 
393 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  25.75 
 
 
385 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  26.51 
 
 
392 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  26.28 
 
 
400 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  26.02 
 
 
393 aa  103  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  28.07 
 
 
393 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 
387 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  28.36 
 
 
393 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  26.36 
 
 
388 aa  102  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>