More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3422 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3422  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 410 aa  827    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2060  aspartate aminotransferase  77.32 
 
 		 405 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3437  aspartate aminotransferase  77.13 
 
 		 406 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3082  aspartate aminotransferase  77.37 
 
 		 406 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.410031 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9152  aspartate aminotransferase  66.83 
 
 		 409 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  27.38 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  27.22 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  26.87 
 
 		 386 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  28.28 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  29.12 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  28.02 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  28.35 
 
 		 367 aa  116  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  26.48 
 
 		 396 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  30.43 
 
 		 386 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  26.46 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  26.48 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  26.2 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  28.01 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  25.19 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  26.63 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  29.07 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  24.87 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  25 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  26.18 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  26.18 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  26.18 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  26.63 
 
 		 394 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  26.18 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  26.18 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  30.04 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  26.88 
 
 		 396 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  23.67 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  26.74 
 
 		 396 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  24.29 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  28.91 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  24.34 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  24.58 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  25.8 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  24.65 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  29.5 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  27.35 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  22.16 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  24.93 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  31.64 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  25.07 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  28.74 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  24.57 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  22.83 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  26.09 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  31.64 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  25.36 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  26.34 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  26.16 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  29.33 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  22.35 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  25.5 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  22.35 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  26.42 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  28.79 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  25.59 
 
 		 389 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  28.3 
 
 		 393 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  24.29 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  25.58 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  28.12 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  27.33 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  29.87 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  22.19 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  24.59 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  23.94 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  24.84 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  27.44 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  25.16 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  27.03 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  28.99 
 
 		 381 aa  103  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  26.69 
 
 		 393 aa  103  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  29.14 
 
 		 400 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  26.86 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  27.25 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  24 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  24 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  27.46 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  27.94 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  26.28 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  27.3 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  27.51 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  25.47 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  27.57 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  25.22 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  25.93 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  23.16 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  25.22 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  27.02 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  26.45 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  26.5 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  26.35 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  23.87 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  24.47 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  24.53 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  24.29 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  23.71 
 
 		 388 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>