More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3457 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  41.1 
 
 
395 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  42.34 
 
 
392 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  42.27 
 
 
391 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  39.94 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  42.64 
 
 
393 aa  253  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  41.78 
 
 
392 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  41.78 
 
 
392 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  38.31 
 
 
389 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  37.71 
 
 
387 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  38.26 
 
 
391 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  36.53 
 
 
387 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  38.52 
 
 
391 aa  235  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  36.62 
 
 
389 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  37.18 
 
 
389 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  37.46 
 
 
387 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  33.24 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  35.2 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  34.63 
 
 
392 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  34.5 
 
 
451 aa  199  9e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  33.52 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  29.78 
 
 
387 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  30.77 
 
 
392 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  30.47 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  31.59 
 
 
400 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  28.13 
 
 
391 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  31.77 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  30.29 
 
 
417 aa  146  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  27.93 
 
 
388 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  30.32 
 
 
409 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  27.55 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  31.3 
 
 
414 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  30.92 
 
 
402 aa  137  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  30.88 
 
 
398 aa  137  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  32.27 
 
 
391 aa  133  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  27.99 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  27.78 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  30.27 
 
 
402 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  28.57 
 
 
387 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  28.53 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  32.91 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  31.8 
 
 
398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  29.94 
 
 
404 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  32.35 
 
 
393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  29.89 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  27.55 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  29.3 
 
 
370 aa  126  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  31.76 
 
 
393 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  27.85 
 
 
397 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  28.9 
 
 
400 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  27.33 
 
 
387 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1423  aminotransferase  31.66 
 
 
384 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  28.3 
 
 
388 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  29.86 
 
 
411 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  29.56 
 
 
393 aa  123  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  28.37 
 
 
389 aa  123  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  28.53 
 
 
399 aa  123  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  27.05 
 
 
387 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  30.15 
 
 
401 aa  122  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  31.07 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  29.17 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  30.31 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  27.22 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  27.6 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  28.89 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  29.61 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  27.52 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  28.21 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.59 
 
 
444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  28.61 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  27.52 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  27.52 
 
 
387 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  31.37 
 
 
410 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  26.42 
 
 
398 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  28.78 
 
 
416 aa  119  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  28.53 
 
 
402 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  25.47 
 
 
399 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  29.44 
 
 
460 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  27.25 
 
 
387 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  27.25 
 
 
387 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  27.38 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  29.66 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  27.58 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  26.98 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  28.43 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  27.47 
 
 
391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  28.8 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  27.11 
 
 
388 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  27.05 
 
 
387 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  29.45 
 
 
403 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  24.77 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  26.59 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  30.21 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  26.16 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  31.71 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2490  putative aminotransferase  27.87 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  27.36 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 
398 aa  117  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  33.19 
 
 
415 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  29.75 
 
 
388 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>