More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3621 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  802    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  74.04 
 
 
389 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  74.36 
 
 
391 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  73.97 
 
 
389 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  74.1 
 
 
391 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  64.01 
 
 
387 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  37.53 
 
 
395 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  37.11 
 
 
391 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  38.32 
 
 
391 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  37.34 
 
 
392 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  36.72 
 
 
387 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  35.68 
 
 
393 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  36.06 
 
 
392 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  34.21 
 
 
389 aa  229  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  36.31 
 
 
387 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  35.81 
 
 
392 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  36.29 
 
 
392 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  38.31 
 
 
390 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  35.82 
 
 
393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  32.72 
 
 
399 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  32.54 
 
 
409 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  31.96 
 
 
400 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  31.85 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  30.79 
 
 
451 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  30.85 
 
 
400 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  29.78 
 
 
402 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  29.4 
 
 
396 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  29.19 
 
 
405 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  31.97 
 
 
401 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 
405 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  30.4 
 
 
367 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  30.16 
 
 
406 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  25.71 
 
 
388 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  25.35 
 
 
391 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  27.79 
 
 
411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  26.97 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  29.54 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  30 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  25.62 
 
 
402 aa  146  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  29.32 
 
 
388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  28.46 
 
 
410 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  29.69 
 
 
398 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  28.65 
 
 
460 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  29.11 
 
 
409 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  30.54 
 
 
414 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  33.54 
 
 
398 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  27.54 
 
 
398 aa  144  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  33.54 
 
 
398 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  33.23 
 
 
398 aa  143  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  29.16 
 
 
401 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  28.26 
 
 
411 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  28.42 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  25.99 
 
 
381 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  29.3 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  27.67 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  25.36 
 
 
395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  27.87 
 
 
412 aa  139  6e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0749  aminotransferase class I and II  26.18 
 
 
401 aa  139  7e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000245467  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  26.88 
 
 
391 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  31.25 
 
 
392 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  25.91 
 
 
388 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  29.19 
 
 
375 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  27.47 
 
 
370 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  28.9 
 
 
371 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  27.25 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  27.79 
 
 
407 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  28.81 
 
 
403 aa  137  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  26.78 
 
 
397 aa  135  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  28.04 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  28.57 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  30.33 
 
 
410 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  27.49 
 
 
415 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  28.48 
 
 
388 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  28.99 
 
 
393 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  29.83 
 
 
393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  28.16 
 
 
387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  26.14 
 
 
387 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  28.61 
 
 
385 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  30.43 
 
 
392 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  28.85 
 
 
390 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  30.14 
 
 
393 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  29.01 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  28.06 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  26.42 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  28.01 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  27.25 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  27.7 
 
 
370 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  28 
 
 
397 aa  131  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  29.47 
 
 
387 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  28.69 
 
 
393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  27.08 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  25.87 
 
 
417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  28.61 
 
 
395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  28.42 
 
 
388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  26.43 
 
 
402 aa  130  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  27.74 
 
 
387 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  26.42 
 
 
396 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  27.3 
 
 
393 aa  130  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  26.42 
 
 
396 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  24.24 
 
 
388 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>