More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1803 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 416 aa  854    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  57.95 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  58.21 
 
 		 405 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  42.28 
 
 		 404 aa  282  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  35.81 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  38.76 
 
 		 427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  36.95 
 
 		 409 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  39.84 
 
 		 409 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  38.38 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  37.53 
 
 		 406 aa  259  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  37.38 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  40.28 
 
 		 412 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  37.4 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  37.79 
 
 		 407 aa  255  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  36.9 
 
 		 418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  36.77 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  36.39 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  38.59 
 
 		 426 aa  252  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  36.75 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  37.5 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  38.84 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  38.08 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  35.66 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  35.48 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  36.95 
 
 		 413 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  36.32 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  36.73 
 
 		 518 aa  245  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  36.64 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  37.57 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  38.26 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  38.23 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3862  aminotransferase AlaT  35.28 
 
 		 408 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  36.55 
 
 		 414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  37.06 
 
 		 403 aa  242  7e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  39.12 
 
 		 415 aa  242  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  34.41 
 
 		 546 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  35.31 
 
 		 410 aa  242  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  36.55 
 
 		 410 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  34.41 
 
 		 545 aa  242  9e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  36.76 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1552  aminotransferase AlaT  37.31 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  36.43 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  37.83 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  37.99 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2271  aminotransferase AlaT  39.72 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  36 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  34.65 
 
 		 543 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  38.83 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2233  aminotransferase AlaT  39.72 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  37.73 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  36.29 
 
 		 508 aa  237  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  36.39 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2397  aminotransferase AlaT  39.72 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  37.85 
 
 		 404 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  36.29 
 
 		 429 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  36.29 
 
 		 429 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  36.72 
 
 		 410 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  35.64 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1805  aminotransferase AlaT  38.78 
 
 		 416 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605572  hitchhiker  0.00221354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  35.64 
 
 		 404 aa  236  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  37.18 
 
 		 404 aa  235  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  36.46 
 
 		 404 aa  235  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2382  aminotransferase AlaT  39.06 
 
 		 416 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378637  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2189  aminotransferase AlaT  35.92 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0930  aminotransferase AlaT  39.2 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703873  normal  0.497759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  35.64 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  36.39 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  36.39 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  35.64 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  36.49 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  37.63 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  35.64 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  35.64 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  37.63 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  37.37 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  35.64 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  36.17 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  36.12 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1348  aminotransferase AlaT  36.87 
 
 		 410 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.613177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  36.72 
 
 		 410 aa  232  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  35.68 
 
 		 404 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  35.24 
 
 		 400 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  34.55 
 
 		 534 aa  232  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  35.82 
 
 		 404 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  35.82 
 
 		 404 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1765  aminotransferase AlaT  38.06 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436136  normal  0.213535 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  35.08 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  36.76 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  35.35 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  34.84 
 
 		 505 aa  231  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  35.9 
 
 		 404 aa  231  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.5 
 
 		 415 aa  230  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  35.41 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2579  aminotransferase AlaT  36.79 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5156  aminotransferase AlaT  38.61 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.32187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  36.56 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1418  aminotransferase AlaT  38.61 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00886152  normal  0.0522162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  36.56 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  36.56 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  36.56 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>