More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5139 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 405 aa  837    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  70.79 
 
 		 412 aa  594  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  66.25 
 
 		 406 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  66.5 
 
 		 406 aa  579  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3862  aminotransferase AlaT  60.64 
 
 		 408 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693995 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  60 
 
 		 404 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  60.74 
 
 		 404 aa  535  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  61.65 
 
 		 404 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  61.94 
 
 		 403 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3615  aminotransferase AlaT  61.94 
 
 		 403 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  59.75 
 
 		 404 aa  531  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  59.01 
 
 		 413 aa  529  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  61.06 
 
 		 403 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  61.79 
 
 		 403 aa  529  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  59.75 
 
 		 404 aa  528  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  61.48 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  60.7 
 
 		 403 aa  528  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  61.44 
 
 		 403 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  60.64 
 
 		 410 aa  531  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3983  aminotransferase AlaT  61.44 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  59.01 
 
 		 429 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  60 
 
 		 404 aa  526  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  59.51 
 
 		 404 aa  527  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  58.42 
 
 		 407 aa  525  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  60.95 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  61.23 
 
 		 422 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  61.82 
 
 		 440 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  60.45 
 
 		 405 aa  524  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  58.77 
 
 		 413 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  60.25 
 
 		 426 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  59.25 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1447  aminotransferase AlaT  60.55 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0541953  normal  0.418968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  57.53 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  59.6 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1481  aminotransferase AlaT  59.95 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  59.25 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  58.19 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  58.27 
 
 		 418 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  59.25 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  59.5 
 
 		 404 aa  521  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3843  aminotransferase AlaT  60.55 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0237926  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  59.25 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  58.75 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  58.75 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1872  aminotransferase AlaT  60.55 
 
 		 403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.866522  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  58.46 
 
 		 404 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  58.75 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  58.75 
 
 		 405 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  58.71 
 
 		 404 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  58.71 
 
 		 404 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  58.75 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  58.75 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  58.75 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  58.75 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  58.75 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1805  aminotransferase AlaT  59.02 
 
 		 416 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605572  hitchhiker  0.00221354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  57.78 
 
 		 411 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  57.14 
 
 		 546 aa  511  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  57.78 
 
 		 426 aa  511  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  59.36 
 
 		 418 aa  511  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2382  aminotransferase AlaT  58.78 
 
 		 416 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378637  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  57.64 
 
 		 545 aa  512  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  57.78 
 
 		 409 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  59.25 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  57.53 
 
 		 412 aa  511  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  57.18 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0930  aminotransferase AlaT  58.19 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703873  normal  0.497759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  57.71 
 
 		 409 aa  508  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  58.25 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  58.06 
 
 		 543 aa  508  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  56.79 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  58.25 
 
 		 404 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1765  aminotransferase AlaT  59.41 
 
 		 412 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436136  normal  0.213535 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  60.32 
 
 		 377 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2579  aminotransferase AlaT  58.17 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2233  aminotransferase AlaT  58.19 
 
 		 412 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  57.28 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1879  aminotransferase AlaT  59.66 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123534  hitchhiker  0.0000142896 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6224  aminotransferase AlaT  59.66 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0441  aminotransferase AlaT  61.23 
 
 		 428 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  57.43 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1855  aminotransferase AlaT  59.66 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0428  aminotransferase AlaT  61.23 
 
 		 428 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2271  aminotransferase AlaT  58.19 
 
 		 412 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0451  aminotransferase AlaT  61.23 
 
 		 428 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.343085  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  56.79 
 
 		 410 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1418  aminotransferase AlaT  59.41 
 
 		 412 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00886152  normal  0.0522162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  57.78 
 
 		 411 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2271  aminotransferase AlaT  55.56 
 
 		 406 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0597182  normal  0.143817 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2397  aminotransferase AlaT  57.95 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5156  aminotransferase AlaT  59.17 
 
 		 412 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.32187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  56.05 
 
 		 410 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  56.3 
 
 		 409 aa  501  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1793  aminotransferase AlaT  59.41 
 
 		 412 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2189  aminotransferase AlaT  57.18 
 
 		 407 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1348  aminotransferase AlaT  57.67 
 
 		 410 aa  498  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.613177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  57.04 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  56.3 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  58.65 
 
 		 404 aa  495  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  57.04 
 
 		 409 aa  498  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>