More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0177 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  100 
 
 		 391 aa  795    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  39.03 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  39.65 
 
 		 400 aa  289  6e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  37.08 
 
 		 404 aa  285  7e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  35.81 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  37.5 
 
 		 505 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  37.44 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  38.64 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  34.68 
 
 		 404 aa  255  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  39.14 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  37.37 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  37.16 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3862  aminotransferase AlaT  34.58 
 
 		 408 aa  249  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  36.71 
 
 		 409 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  35 
 
 		 543 aa  248  9e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  36.68 
 
 		 426 aa  248  9e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  36.11 
 
 		 414 aa  248  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  37.69 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  36.59 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  36.59 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  36.59 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  35.5 
 
 		 414 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  36.59 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  36.59 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  36.59 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  36.59 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  36.59 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  37 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  37 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  37 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  37 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  36.11 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  36.59 
 
 		 405 aa  246  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  36.23 
 
 		 404 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  35.93 
 
 		 409 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  36.57 
 
 		 508 aa  245  9e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  35 
 
 		 412 aa  245  9e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  37.53 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  36.93 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  34.83 
 
 		 410 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  35.93 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  35.57 
 
 		 546 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  35.41 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  36.91 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  35.82 
 
 		 545 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  36.66 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  37.09 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  35.1 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  36.41 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  35.5 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  36.11 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  34.83 
 
 		 418 aa  242  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  36.43 
 
 		 404 aa  242  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  36.68 
 
 		 404 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  36.68 
 
 		 404 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  36.34 
 
 		 409 aa  242  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  36.34 
 
 		 427 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  36.68 
 
 		 403 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  36.66 
 
 		 404 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  35.84 
 
 		 423 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  36.34 
 
 		 409 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  35.43 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  36.84 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  35.43 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  36.34 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  36.91 
 
 		 403 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  33.25 
 
 		 426 aa  240  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  35.18 
 
 		 404 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  35.68 
 
 		 415 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  33.33 
 
 		 413 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  36.91 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  33.83 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  33.42 
 
 		 409 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  35.57 
 
 		 404 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  34.67 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  36.78 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  35.44 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  35.44 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  35.1 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  37.31 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3615  aminotransferase AlaT  36.78 
 
 		 403 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  34.42 
 
 		 426 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1348  aminotransferase AlaT  34.16 
 
 		 410 aa  236  8e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.613177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  34.85 
 
 		 404 aa  235  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  37.06 
 
 		 403 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  34.85 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  33.58 
 
 		 429 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3843  aminotransferase AlaT  36.02 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0237926  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  34.24 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  34.6 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  36.15 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  34.76 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  33.58 
 
 		 413 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  33.83 
 
 		 406 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  35.61 
 
 		 403 aa  232  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1872  aminotransferase AlaT  36.09 
 
 		 403 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.866522  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1481  aminotransferase AlaT  36.02 
 
 		 403 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  33.42 
 
 		 405 aa  232  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>