More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1781 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 405 aa  835    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  75.99 
 
 		 404 aa  649    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  58.21 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  43.04 
 
 		 404 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  39.03 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  38.48 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  37.56 
 
 		 518 aa  278  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  37.91 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  37.59 
 
 		 426 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  36.72 
 
 		 404 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  35.56 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  39.14 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  37.38 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1348  aminotransferase AlaT  36.59 
 
 		 410 aa  265  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.613177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  35.8 
 
 		 404 aa  265  8e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  35.56 
 
 		 404 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  37.04 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  35.22 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  35.22 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  37.91 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  38.01 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  35.31 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  38.42 
 
 		 534 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  34.81 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  34.83 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  37.41 
 
 		 411 aa  262  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  34.81 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1552  aminotransferase AlaT  39.03 
 
 		 409 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  34.81 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  34.81 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  35.97 
 
 		 409 aa  262  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  35.4 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  37.38 
 
 		 427 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  34.81 
 
 		 404 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  35.64 
 
 		 404 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  37.53 
 
 		 505 aa  259  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  35.31 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  37.13 
 
 		 406 aa  259  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  36.2 
 
 		 409 aa  259  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  37.91 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  38.77 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  35.66 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  36.14 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  36.88 
 
 		 406 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  34.41 
 
 		 403 aa  256  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3862  aminotransferase AlaT  35.66 
 
 		 408 aa  256  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  34.67 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  37.09 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  34.58 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  35.89 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2397  aminotransferase AlaT  38.89 
 
 		 415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2271  aminotransferase AlaT  38.89 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2233  aminotransferase AlaT  38.89 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  35 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  36.9 
 
 		 407 aa  252  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  37.37 
 
 		 403 aa  252  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  36.07 
 
 		 404 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  37.9 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  37.63 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  35.96 
 
 		 543 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  36.64 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  36.75 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  38.54 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  34.84 
 
 		 546 aa  248  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  34.59 
 
 		 545 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.73 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  33.83 
 
 		 423 aa  247  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0930  aminotransferase AlaT  38.38 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703873  normal  0.497759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  38.58 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5156  aminotransferase AlaT  38.29 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.32187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  36.22 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2382  aminotransferase AlaT  39.49 
 
 		 416 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378637  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  36.61 
 
 		 415 aa  246  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1765  aminotransferase AlaT  37.37 
 
 		 412 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436136  normal  0.213535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  36.41 
 
 		 429 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  36.41 
 
 		 429 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  35.25 
 
 		 404 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  35.25 
 
 		 404 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  35.25 
 
 		 404 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  35.25 
 
 		 404 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  35.98 
 
 		 413 aa  245  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  35.71 
 
 		 426 aa  245  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  38.13 
 
 		 403 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  35.25 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  35 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  35.75 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  37.88 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  34.99 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  35.52 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  36.54 
 
 		 508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  36.67 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1418  aminotransferase AlaT  37.37 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00886152  normal  0.0522162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1805  aminotransferase AlaT  38.97 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605572  hitchhiker  0.00221354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  33.5 
 
 		 409 aa  243  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  35.22 
 
 		 418 aa  242  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1481  aminotransferase AlaT  37.28 
 
 		 403 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  35.48 
 
 		 413 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  35.48 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  34.75 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  34.75 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>