More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2474 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  795    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  59.59 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  56.04 
 
 		 389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  58.14 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  59.85 
 
 		 392 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  38.94 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  40.66 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  37.76 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  37.85 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  37.66 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  39.89 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  37.33 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  40.77 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  36.62 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  35.6 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  40.25 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  40 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  35.68 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  40.37 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  35.2 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  28.15 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  27.3 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  30.57 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  27.11 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  29.24 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  32.13 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  27.62 
 
 		 391 aa  136  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.17 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  26.15 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  27.6 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  27.59 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  28.95 
 
 		 394 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  25.58 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  30.92 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  29.19 
 
 		 400 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  29.55 
 
 		 393 aa  126  6e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  27.09 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  28.97 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  31.22 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  29.09 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  27.92 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.9 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  28.66 
 
 		 401 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  28.4 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  29.95 
 
 		 392 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  29.08 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  27.33 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  25.54 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  27.79 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  26.25 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  28.01 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3792  aminotransferase class I and II  24.16 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  28.15 
 
 		 388 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  30.21 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  28.66 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  28.53 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  28.05 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1938  aminotransferase class I and II  23.77 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  27.3 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  28.31 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  25.98 
 
 		 377 aa  117  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  25.98 
 
 		 377 aa  117  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  28 
 
 		 380 aa  116  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  27.34 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  27.08 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 		 408 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  26.9 
 
 		 385 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  28 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  26.9 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  29.79 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  27.33 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  27.37 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  28.05 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  28 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  28.24 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  27.81 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3786  aminotransferase  30.49 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267756 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  25.15 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  26.46 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  26.26 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  26.65 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  26.65 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  26.48 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  27.02 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  25.57 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  28.53 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  29.47 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  28.49 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  27.94 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  26.65 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  28.53 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  27.3 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  28.13 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  26.77 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  26.69 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  26.98 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  29.77 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  27.95 
 
 		 416 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>