More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3898 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
409 aa  838    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  62.2 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  61.66 
 
 
392 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  62.02 
 
 
400 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  40.93 
 
 
393 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  40.4 
 
 
404 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  39.69 
 
 
399 aa  262  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  36.69 
 
 
388 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  40.73 
 
 
387 aa  256  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  39.53 
 
 
386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  39.69 
 
 
390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  39.74 
 
 
393 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  39.66 
 
 
410 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  37.76 
 
 
386 aa  250  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  40.84 
 
 
388 aa  250  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  38.22 
 
 
396 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  36.69 
 
 
391 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  38.48 
 
 
396 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  36.98 
 
 
398 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  38.22 
 
 
396 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  36.2 
 
 
388 aa  247  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  38.22 
 
 
396 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  40.11 
 
 
405 aa  246  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  38.22 
 
 
396 aa  245  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  37.96 
 
 
396 aa  245  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  37.96 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  37.96 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  37.96 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  37.96 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  38.38 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  38.46 
 
 
399 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  37.96 
 
 
396 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  36.92 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
398 aa  243  5e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  36.91 
 
 
370 aa  243  5e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  36.72 
 
 
398 aa  242  7.999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  37.95 
 
 
412 aa  242  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  39.07 
 
 
394 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  38.6 
 
 
397 aa  242  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  35.01 
 
 
400 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  40.73 
 
 
367 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  36.62 
 
 
407 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  37.4 
 
 
396 aa  240  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 
393 aa  240  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  35.34 
 
 
397 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  34.86 
 
 
395 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  34.55 
 
 
387 aa  239  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  36.9 
 
 
387 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  35.34 
 
 
397 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  37.14 
 
 
385 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  37.37 
 
 
389 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  35.79 
 
 
379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  34.03 
 
 
387 aa  236  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  39.39 
 
 
390 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  34.29 
 
 
387 aa  236  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  37.17 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  37.43 
 
 
402 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  33.77 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  33.51 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  33.77 
 
 
387 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  34.61 
 
 
375 aa  233  6e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  33.77 
 
 
387 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  37.69 
 
 
395 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  33.25 
 
 
387 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  42.08 
 
 
398 aa  230  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  33.51 
 
 
387 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  36.56 
 
 
412 aa  229  5e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  33.51 
 
 
387 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  33.25 
 
 
385 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  35.44 
 
 
397 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  37.22 
 
 
390 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  35.82 
 
 
375 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  37.02 
 
 
375 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  37.16 
 
 
375 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  35.58 
 
 
399 aa  226  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  33.08 
 
 
395 aa  226  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  38.12 
 
 
386 aa  226  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  32.72 
 
 
387 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  34.88 
 
 
400 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  39.38 
 
 
390 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  34.69 
 
 
387 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  34.53 
 
 
401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  36.03 
 
 
388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  34.74 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  33.51 
 
 
390 aa  222  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  36.2 
 
 
379 aa  222  8e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  32.57 
 
 
395 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  32.57 
 
 
395 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  32.57 
 
 
395 aa  222  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  32.57 
 
 
395 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  32.57 
 
 
395 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  36.27 
 
 
391 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  32.32 
 
 
395 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  36.97 
 
 
388 aa  220  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  36.41 
 
 
369 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  35.57 
 
 
379 aa  221  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  32.02 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  34.52 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  39.39 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  32.32 
 
 
395 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>