More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2542 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  80.83 
 
 
400 aa  636    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
399 aa  808    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  78.01 
 
 
392 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  62.2 
 
 
409 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  40.48 
 
 
404 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  40.57 
 
 
412 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  43.5 
 
 
367 aa  257  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  35.49 
 
 
388 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  36.05 
 
 
398 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  38.99 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  36.18 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  36.65 
 
 
386 aa  243  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 
398 aa  242  7.999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  36.05 
 
 
398 aa  242  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  33.85 
 
 
388 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  39.35 
 
 
370 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  37.86 
 
 
394 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  32.73 
 
 
375 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  39.14 
 
 
405 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  36.34 
 
 
390 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  35.92 
 
 
396 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  38.6 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  35.25 
 
 
396 aa  236  7e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  34.88 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  35.56 
 
 
375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  36.18 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  37.08 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  34.63 
 
 
396 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  34.88 
 
 
396 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  34.88 
 
 
396 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  34.03 
 
 
391 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  37.21 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  33.77 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 
407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
395 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  34.63 
 
 
396 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
395 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  34.63 
 
 
396 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
395 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  34.63 
 
 
396 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
395 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
395 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  34.63 
 
 
396 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  33.58 
 
 
395 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  35.77 
 
 
396 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  34.88 
 
 
396 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  38.44 
 
 
388 aa  232  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  33.08 
 
 
395 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  36.43 
 
 
389 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
395 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  35.82 
 
 
386 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  35 
 
 
375 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  34.13 
 
 
375 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  36.79 
 
 
385 aa  230  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  35.42 
 
 
400 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 
386 aa  230  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  33.87 
 
 
395 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  31.42 
 
 
397 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  35.61 
 
 
393 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  33.84 
 
 
395 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  33.87 
 
 
395 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  36.6 
 
 
379 aa  227  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  37.16 
 
 
401 aa  227  3e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  37.87 
 
 
401 aa  227  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  34.06 
 
 
390 aa  226  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  41.42 
 
 
444 aa  226  4e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  32.83 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  31.17 
 
 
397 aa  226  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  41.47 
 
 
373 aa  225  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 
398 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  35.21 
 
 
400 aa  224  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  36.04 
 
 
402 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  33.42 
 
 
399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  37.15 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  36.79 
 
 
399 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  32.73 
 
 
387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  36.48 
 
 
410 aa  219  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  32.73 
 
 
387 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  32.47 
 
 
387 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  37.05 
 
 
386 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  34.03 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  32.22 
 
 
387 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  32.47 
 
 
387 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  39.78 
 
 
393 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  33.43 
 
 
375 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  32.47 
 
 
387 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  37.18 
 
 
390 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  38.4 
 
 
404 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  33.67 
 
 
393 aa  218  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  32.55 
 
 
385 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  34.17 
 
 
390 aa  216  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2538  aminotransferase class I and II  40.1 
 
 
373 aa  216  7e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.408129  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  37.43 
 
 
393 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  32.22 
 
 
387 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  34.37 
 
 
397 aa  215  9e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  32.22 
 
 
387 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  32.55 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  35.36 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  36.1 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  34.2 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>