More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0168 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 400 aa  827    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  74.11 
 
 		 397 aa  615  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  73.02 
 
 		 379 aa  599  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  53.58 
 
 		 393 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  55.12 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  52.94 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  49.48 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  47.49 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  42.82 
 
 		 387 aa  342  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  47.8 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  47.06 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  42.34 
 
 		 413 aa  295  7e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  39.14 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.86 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  42.15 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  41.71 
 
 		 397 aa  288  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  42.4 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  39.84 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.74 
 
 		 387 aa  285  7e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  40.11 
 
 		 383 aa  285  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  39.63 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  39.89 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  39.78 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  40.62 
 
 		 385 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  40.48 
 
 		 394 aa  282  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  41.15 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  42.51 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  39.89 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 		 389 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  39.59 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  41.08 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  37.87 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  38.95 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  40.64 
 
 		 386 aa  276  6e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  40.79 
 
 		 393 aa  275  8e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  39.62 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.14 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  40.42 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.13 
 
 		 402 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  40 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  37.96 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  39.44 
 
 		 400 aa  270  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  38.32 
 
 		 390 aa  269  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  37.87 
 
 		 385 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  39.57 
 
 		 392 aa  268  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  39.84 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  38.62 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  37.8 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  37.5 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  38.02 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  37.8 
 
 		 391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  37.8 
 
 		 391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  37.8 
 
 		 384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  37.87 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  37.8 
 
 		 391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  37.8 
 
 		 391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  37.8 
 
 		 391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  38.4 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  37.5 
 
 		 390 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  37.5 
 
 		 390 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  37.74 
 
 		 386 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  38.83 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  40.2 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  41.3 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  36.51 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  40.53 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  37.6 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  38.81 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  37.33 
 
 		 384 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2834  aminotransferase class I and II  39.4 
 
 		 386 aa  263  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  39.42 
 
 		 381 aa  262  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  37.06 
 
 		 386 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  36.98 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  36.46 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.37 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  36.46 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  39.64 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  36.39 
 
 		 382 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  38.12 
 
 		 384 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  38.01 
 
 		 382 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  36.18 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  37.21 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  37.43 
 
 		 409 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  35.14 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  37.5 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.46 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  36.18 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  37.17 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2490  putative aminotransferase  35.65 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228647  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  37.8 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  39.39 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  36.77 
 
 		 384 aa  256  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  35.86 
 
 		 389 aa  256  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  35.31 
 
 		 382 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  37.94 
 
 		 391 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  36.39 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  36.36 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  37.57 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  37.76 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>