More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1145 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  801    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  65.88 
 
 		 392 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  64.83 
 
 		 392 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  64.57 
 
 		 392 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  63.09 
 
 		 391 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  62.57 
 
 		 395 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  58.78 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  41.78 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  40.73 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  37.11 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  41.53 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  41.26 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  39.89 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  35.92 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  37.17 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  39.18 
 
 		 392 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  37.14 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  35.17 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  34.91 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  33.88 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  33.06 
 
 		 401 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  31.87 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  29.36 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  28 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  31.04 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  32.82 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  31.75 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  29.34 
 
 		 391 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  28.41 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  27.81 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  27.65 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  30.73 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  32.43 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  28.44 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  27.46 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  26.53 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  27.12 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  31.39 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  30.22 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  27.45 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  30.03 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  24.88 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  29.59 
 
 		 385 aa  123  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  30.53 
 
 		 393 aa  122  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  27.23 
 
 		 393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  27.87 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  27.35 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  27.65 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  28.01 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  26.58 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.59 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  27.65 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  29.32 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  26.9 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  25.82 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  26.53 
 
 		 388 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  30.17 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  28.25 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1507  aspartate aminotransferase  26.93 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  27.58 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  29.55 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  25.71 
 
 		 404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  29.11 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  27.7 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  29.84 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  25.94 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1182  aspartate aminotransferase  31.65 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.410689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  26.8 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  30.32 
 
 		 387 aa  117  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  26.42 
 
 		 399 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1423  aminotransferase  30.09 
 
 		 384 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  24.03 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  28.02 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  29.14 
 
 		 384 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  24.03 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  26.13 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  28.18 
 
 		 389 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  30.84 
 
 		 388 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  28.96 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0063  aspartate aminotransferase  30.51 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  27.95 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  30.45 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  29.43 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  28.33 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  29.44 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  27.53 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  28.65 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  24.86 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  29.54 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.23 
 
 		 417 aa  113  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  29.49 
 
 		 396 aa  113  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  26.37 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  28.73 
 
 		 397 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  29.21 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  30.53 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1242  aspartate aminotransferase  25.89 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  25.67 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  27.81 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3182  aminotransferase class I and II  30.31 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>