More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2081 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  93.47 
 
 		 385 aa  747    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  95.57 
 
 		 384 aa  761    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  88.28 
 
 		 384 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  793    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  83.99 
 
 		 384 aa  656    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  84.86 
 
 		 387 aa  690    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  80.84 
 
 		 383 aa  627  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  67.72 
 
 		 384 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  65.08 
 
 		 383 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  66.14 
 
 		 398 aa  527  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  64.8 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  65.07 
 
 		 394 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  64.53 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  61.54 
 
 		 383 aa  488  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  61.8 
 
 		 409 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  57.41 
 
 		 388 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  51.04 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  52.51 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  50.8 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  48.04 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  47.89 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  46.15 
 
 		 391 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  47.85 
 
 		 382 aa  336  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  46.28 
 
 		 391 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  46.51 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  47 
 
 		 387 aa  322  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  44.13 
 
 		 395 aa  318  9e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  43.16 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  44.99 
 
 		 389 aa  312  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  42.52 
 
 		 393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  44.62 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.86 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  44.09 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  44.09 
 
 		 391 aa  301  9e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  43.35 
 
 		 397 aa  300  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  43.46 
 
 		 409 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  41.49 
 
 		 387 aa  295  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  43.32 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  42.29 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  43.2 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  43.12 
 
 		 389 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  43.82 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  43.16 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  39.89 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.48 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.12 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  44.62 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.4 
 
 		 402 aa  286  5.999999999999999e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  43.2 
 
 		 391 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  41.91 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  42.59 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  42.59 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  44.39 
 
 		 397 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.42 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  41.11 
 
 		 400 aa  279  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  43.31 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  42.55 
 
 		 399 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  43.05 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.59 
 
 		 408 aa  276  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  42.74 
 
 		 390 aa  276  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2072  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 		 381 aa  275  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  41.46 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  41.11 
 
 		 389 aa  273  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  41.35 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  42.16 
 
 		 390 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  41.46 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.43 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2834  aminotransferase class I and II  43.08 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  40.16 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  38.69 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  39.02 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  41.19 
 
 		 390 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  40.16 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  39.02 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  37.87 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  42.43 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  42.43 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  42.43 
 
 		 384 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  42.43 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  42.43 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  42.43 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  42.43 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  42.43 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 386 aa  269  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  38.38 
 
 		 385 aa  268  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  39.08 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  38.27 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  41.62 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  42.16 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  38.27 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  40.11 
 
 		 399 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  41.49 
 
 		 389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  38.27 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  38.27 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  38.27 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  38.27 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  40.75 
 
 		 390 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  40.92 
 
 		 383 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  41.08 
 
 		 390 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  40.92 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>