More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2104 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  87.47 
 
 		 387 aa  712    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  83.81 
 
 		 383 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  88.51 
 
 		 385 aa  712    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  88.8 
 
 		 384 aa  716    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  789    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  88.28 
 
 		 384 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  86.35 
 
 		 384 aa  676    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  68.41 
 
 		 384 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  66.4 
 
 		 383 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  66.93 
 
 		 398 aa  528  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  64.99 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  64.72 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  64.46 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  60.79 
 
 		 383 aa  485  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  62.86 
 
 		 409 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  57.14 
 
 		 388 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  52.77 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  52.24 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  52.41 
 
 		 397 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  49.09 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  49.74 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 382 aa  349  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  48.14 
 
 		 391 aa  344  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  45.62 
 
 		 391 aa  338  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  47.2 
 
 		 394 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  47.03 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  45.99 
 
 		 395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  45.89 
 
 		 386 aa  323  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  47.37 
 
 		 387 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  44.92 
 
 		 395 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  47.3 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  44.5 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  45.16 
 
 		 391 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  44.95 
 
 		 397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  43.01 
 
 		 387 aa  312  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  45.16 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  46.51 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  44.53 
 
 		 391 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.39 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.36 
 
 		 385 aa  301  9e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  42.82 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  45.19 
 
 		 409 aa  300  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  44.12 
 
 		 413 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  44.88 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.5 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  44.27 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  42.71 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  43.62 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  43.97 
 
 		 400 aa  293  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  43.04 
 
 		 413 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  43.58 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  39.61 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  43.75 
 
 		 399 aa  289  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  44.39 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  44.92 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  41.64 
 
 		 400 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  43.55 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  42.71 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  42.93 
 
 		 390 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  42.71 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  42.55 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  41.99 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  42.4 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  41.89 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  41.51 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  42.28 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  42.67 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  41.75 
 
 		 389 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.67 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  43.12 
 
 		 397 aa  279  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  43.51 
 
 		 391 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  43.51 
 
 		 384 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  43.51 
 
 		 391 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  43.51 
 
 		 391 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  43.51 
 
 		 391 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  43.51 
 
 		 391 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  39.24 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  43.24 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  40.11 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  42.67 
 
 		 390 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  42.67 
 
 		 390 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  40.11 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  42.41 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  38.92 
 
 		 385 aa  275  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 385 aa  275  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 385 aa  275  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  40 
 
 		 379 aa  275  9e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  40.31 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  39.62 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  42.47 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  41.55 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  42.16 
 
 		 389 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  41.29 
 
 		 390 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  42.09 
 
 		 394 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  41.13 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  41.13 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  39.3 
 
 		 386 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  39.62 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  41.19 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  40.42 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>