More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3059 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  802    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  69.97 
 
 		 388 aa  526  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  64.69 
 
 		 392 aa  521  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  63.43 
 
 		 394 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  56.5 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  52.25 
 
 		 387 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  55.7 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  55.79 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  55.96 
 
 		 384 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  52.52 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  56.33 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  56.6 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  50.13 
 
 		 385 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  50.39 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  52.66 
 
 		 391 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  50.13 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  53.05 
 
 		 384 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  54.38 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  53.63 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  52.52 
 
 		 388 aa  388  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  54.52 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  52.96 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  53.72 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  53.32 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.93 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  52.53 
 
 		 386 aa  365  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  54.83 
 
 		 397 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  55.05 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  53.74 
 
 		 389 aa  355  6.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  53.02 
 
 		 395 aa  353  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.76 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 		 384 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  51.03 
 
 		 409 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  49.22 
 
 		 391 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  51.72 
 
 		 391 aa  346  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  53.65 
 
 		 387 aa  345  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  51.83 
 
 		 413 aa  345  7e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  52.8 
 
 		 387 aa  345  8e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  51.6 
 
 		 395 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  50.52 
 
 		 397 aa  340  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  51.44 
 
 		 395 aa  339  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  52.14 
 
 		 381 aa  338  8e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  50.94 
 
 		 400 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  47.91 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  48.66 
 
 		 389 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  49.87 
 
 		 402 aa  332  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  48.17 
 
 		 391 aa  331  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  45.84 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  49.6 
 
 		 389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  47.48 
 
 		 387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  46.26 
 
 		 390 aa  325  9e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  46.52 
 
 		 384 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  46.52 
 
 		 391 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  46.52 
 
 		 391 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  46.52 
 
 		 391 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  46.52 
 
 		 391 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  46.52 
 
 		 391 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  46.26 
 
 		 384 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  45.09 
 
 		 390 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  48.53 
 
 		 389 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  51.71 
 
 		 402 aa  322  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  48.53 
 
 		 389 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  50.53 
 
 		 401 aa  322  8e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  44.56 
 
 		 390 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  45.09 
 
 		 390 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  45.09 
 
 		 390 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  44.03 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  49.23 
 
 		 413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  44.62 
 
 		 400 aa  319  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  44.03 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  47.09 
 
 		 393 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  44.03 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  43.65 
 
 		 389 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  42.33 
 
 		 385 aa  312  7.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  48.42 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  42.33 
 
 		 390 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  42.51 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  42.59 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  41.8 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  43.19 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  41.73 
 
 		 385 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  42.06 
 
 		 390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  43.5 
 
 		 390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  43.39 
 
 		 390 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  48.69 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  47.93 
 
 		 408 aa  302  6.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  41.27 
 
 		 385 aa  302  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  40.63 
 
 		 386 aa  302  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  40.63 
 
 		 386 aa  302  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  40.37 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  40.89 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  42.12 
 
 		 413 aa  300  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  40.37 
 
 		 386 aa  299  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  42.6 
 
 		 394 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  40.21 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  40 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  40.21 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  42.36 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  43.39 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  40.21 
 
 		 386 aa  296  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>