More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 387 aa  785    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  75.2 
 
 		 381 aa  564  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  66.67 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  66.05 
 
 		 382 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  64.74 
 
 		 400 aa  494  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  61.04 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  61.42 
 
 		 384 aa  484  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  64.86 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  59.48 
 
 		 391 aa  474  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  61.82 
 
 		 389 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  61.82 
 
 		 389 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  61.03 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  58.96 
 
 		 391 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  60.88 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  60.37 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  58.4 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  62.18 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  62.08 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.05 
 
 		 385 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  56.92 
 
 		 386 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  59.04 
 
 		 401 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  57.51 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.62 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  59.21 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  57.85 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  56.56 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  56.65 
 
 		 409 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  54.01 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  53.85 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.79 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.97 
 
 		 387 aa  362  5.0000000000000005e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  53.51 
 
 		 397 aa  351  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  48.79 
 
 		 383 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.19 
 
 		 408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  45.71 
 
 		 387 aa  332  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  49.19 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  48.93 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  48.25 
 
 		 383 aa  325  7e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  47.3 
 
 		 384 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  47.45 
 
 		 392 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  45.68 
 
 		 387 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  47.17 
 
 		 388 aa  319  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  44.86 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  44.59 
 
 		 384 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  44.86 
 
 		 384 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  45.76 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  46.53 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  45.71 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  45.45 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  45.71 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  45.71 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  45.71 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  45.71 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  45.71 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  45.45 
 
 		 384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  46.76 
 
 		 383 aa  305  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  46.77 
 
 		 394 aa  305  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  44.71 
 
 		 395 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  45.48 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  46.84 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  46.77 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  46.77 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  45.45 
 
 		 394 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  42.86 
 
 		 400 aa  300  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  46.49 
 
 		 384 aa  300  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  43.98 
 
 		 390 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  47.71 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  42.34 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  42.49 
 
 		 390 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  43.82 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  43.56 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.86 
 
 		 390 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  41.69 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  42.49 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  44.8 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  42.36 
 
 		 382 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  41.6 
 
 		 386 aa  292  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  42.86 
 
 		 390 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  42.86 
 
 		 390 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  46.26 
 
 		 409 aa  292  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  41.76 
 
 		 390 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  44.86 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  41.6 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  41.95 
 
 		 389 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  41.55 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  41.03 
 
 		 391 aa  289  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  41.49 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  43.97 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  41.54 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  41.09 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  42.74 
 
 		 379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  41.49 
 
 		 383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  40.74 
 
 		 413 aa  286  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  41.49 
 
 		 383 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  41.69 
 
 		 399 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  39.85 
 
 		 399 aa  286  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  41.82 
 
 		 390 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2600  aminotransferase class I and II  44.59 
 
 		 396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.492563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  41.69 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  40.89 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>