More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0568 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  100 
 
 		 391 aa  790    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  68.8 
 
 		 393 aa  549  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  65.13 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  68.22 
 
 		 387 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  66.93 
 
 		 382 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  61.98 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  61.15 
 
 		 381 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  62.95 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  61.66 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.4 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  56.43 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  54.78 
 
 		 391 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  58.9 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  54.38 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.83 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  55.5 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  54.03 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.57 
 
 		 385 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  55.78 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  53.47 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  53.14 
 
 		 389 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  53.16 
 
 		 397 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  54.92 
 
 		 389 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  54.92 
 
 		 389 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  52.33 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  54.11 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.23 
 
 		 413 aa  354  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  51.66 
 
 		 409 aa  350  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  54.45 
 
 		 402 aa  349  6e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  54.59 
 
 		 421 aa  346  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.9 
 
 		 402 aa  346  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  50.78 
 
 		 388 aa  344  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  50.13 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  51.75 
 
 		 397 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  47.78 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  49.07 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  47.97 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  48.92 
 
 		 394 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  48.83 
 
 		 395 aa  322  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  49.07 
 
 		 388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  46.46 
 
 		 397 aa  319  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  44.27 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  45.16 
 
 		 384 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  48.28 
 
 		 394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  48.28 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  47.31 
 
 		 383 aa  309  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  47.11 
 
 		 394 aa  309  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  48.56 
 
 		 408 aa  309  6.999999999999999e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  44.62 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  47.07 
 
 		 409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  43.82 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  44.09 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  47.04 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  44.09 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  46.91 
 
 		 391 aa  299  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  41.6 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  46.83 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  44.59 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  42.67 
 
 		 385 aa  292  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  41.24 
 
 		 385 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  44.88 
 
 		 390 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  44.91 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  40.44 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  44.68 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  44.21 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  41.09 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  42.93 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  44.89 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  42.74 
 
 		 396 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  42.67 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  44.36 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  40.63 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  44.36 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  44.36 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  44.36 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  37.66 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  44.36 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  44.36 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  44.09 
 
 		 384 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  39.28 
 
 		 386 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  39.28 
 
 		 386 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  39.28 
 
 		 386 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  42.67 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  43.08 
 
 		 383 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  39.53 
 
 		 386 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  40.37 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  40.37 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  39.28 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  39.28 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  43.08 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  39.28 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  39.28 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  42.89 
 
 		 421 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  43.27 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  41.88 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3291  putative aminotransferase  43.73 
 
 		 385 aa  279  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  40.1 
 
 		 386 aa  278  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  44.35 
 
 		 398 aa  278  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  41.36 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  42.48 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>