More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2740 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  798    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  97.97 
 
 		 394 aa  766    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  90.03 
 
 		 394 aa  704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  76.98 
 
 		 383 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  76.19 
 
 		 384 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  73.2 
 
 		 409 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  64.47 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  64.72 
 
 		 384 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  68.12 
 
 		 398 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  64.53 
 
 		 384 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  64.29 
 
 		 385 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  67.73 
 
 		 383 aa  504  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  64.8 
 
 		 384 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  65.78 
 
 		 384 aa  494  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  63.93 
 
 		 383 aa  484  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  61.54 
 
 		 388 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  58.22 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  53.03 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  56.16 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  54.38 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  51.07 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  53.05 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  49.74 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  51.61 
 
 		 389 aa  334  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  50 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  45.84 
 
 		 386 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  48.28 
 
 		 391 aa  319  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  47.48 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  47.87 
 
 		 382 aa  315  8e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  48.84 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  47.35 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.95 
 
 		 385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  47.21 
 
 		 393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  44.17 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  44.17 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  42.15 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  42.15 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  42.28 
 
 		 387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  45.38 
 
 		 395 aa  308  8e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  42.15 
 
 		 386 aa  308  9e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  42.15 
 
 		 386 aa  308  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  42.15 
 
 		 386 aa  308  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  42.15 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  41.88 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  45.24 
 
 		 384 aa  306  6e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  43.63 
 
 		 386 aa  305  7e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  44.09 
 
 		 385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  44.09 
 
 		 385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  41.62 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  46.83 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  42.9 
 
 		 385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  48.8 
 
 		 397 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.77 
 
 		 387 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  42.47 
 
 		 385 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  43.9 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  46.83 
 
 		 413 aa  299  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  46.26 
 
 		 387 aa  299  6e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  48.12 
 
 		 397 aa  298  9e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  44.41 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  46.81 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  42.74 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  43.85 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  39.89 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  41.71 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  41.71 
 
 		 389 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  44.35 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  44.09 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  41.04 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  41.71 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  42.97 
 
 		 388 aa  288  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  43.62 
 
 		 391 aa  288  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  39.85 
 
 		 413 aa  288  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  43.36 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  42.01 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  41.71 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  42.47 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  41.62 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  41.73 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 		 397 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  45.04 
 
 		 400 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  46.6 
 
 		 421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  41.46 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  42.52 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  42.15 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  42.15 
 
 		 390 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  42.2 
 
 		 383 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  40.27 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  44.39 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  44.39 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  42.52 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  42.52 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2072  aminotransferase class I and II  37.94 
 
 		 381 aa  282  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.26 
 
 		 390 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  42.51 
 
 		 389 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  45.21 
 
 		 395 aa  282  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  42.22 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  41.19 
 
 		 396 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.35 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  42.7 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  40.86 
 
 		 389 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>