More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0776 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  782    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  57.33 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  54.38 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  54.38 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  56.1 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  54.13 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  49.47 
 
 		 383 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  49.74 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  49.74 
 
 		 394 aa  346  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  48.81 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  48.14 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  50.66 
 
 		 383 aa  339  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  46.54 
 
 		 387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  49.87 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  46.54 
 
 		 384 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  46.28 
 
 		 384 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  45.62 
 
 		 385 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  47.89 
 
 		 388 aa  328  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  47.87 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  49.6 
 
 		 409 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  47.24 
 
 		 383 aa  322  7e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  46.54 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  50.13 
 
 		 397 aa  301  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  45.99 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  46.91 
 
 		 391 aa  299  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  48.81 
 
 		 413 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.49 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  47.72 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  46.65 
 
 		 409 aa  295  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.24 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  42.89 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  45.58 
 
 		 389 aa  293  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  47.04 
 
 		 381 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  45.71 
 
 		 393 aa  289  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  44.83 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  49.2 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  45.83 
 
 		 397 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.8 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  47.18 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  44.24 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  47.51 
 
 		 395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  42.71 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  45.01 
 
 		 384 aa  282  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  44.27 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  41.25 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  41.58 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  46.89 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  44.03 
 
 		 389 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  41.85 
 
 		 391 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  41.85 
 
 		 391 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  41.85 
 
 		 391 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  41.85 
 
 		 391 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  41.85 
 
 		 391 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  41.85 
 
 		 384 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  41.25 
 
 		 390 aa  278  9e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  47.34 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  41.58 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  40.16 
 
 		 396 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  42.25 
 
 		 390 aa  276  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  46.38 
 
 		 395 aa  275  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  46.95 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  40.92 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  40.77 
 
 		 384 aa  272  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  36.89 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  46.03 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  42.86 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  39.63 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  39.37 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.74 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  39.67 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  39.67 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  39.67 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  38.59 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  38.59 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  44.3 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  44.3 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  47.76 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  39.67 
 
 		 390 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  39.67 
 
 		 390 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  38.59 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  38.59 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  39.84 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  38.59 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  40.43 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  38.32 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  42.33 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  39.67 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  38.59 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  44.3 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  40.49 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  39.52 
 
 		 385 aa  262  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 385 aa  262  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  40.76 
 
 		 383 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  45.66 
 
 		 421 aa  262  8.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  39.89 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  40.22 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  38.32 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  40.49 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1616  putative aminotransferase  43.24 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1559  putative aminotransferase  42.97 
 
 		 410 aa  259  4e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000413042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>