More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3242 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  100 
 
 
392 aa  805    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  65.17 
 
 
397 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  62.66 
 
 
394 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  63.19 
 
 
388 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  56.46 
 
 
383 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  54.57 
 
 
387 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  54.19 
 
 
391 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  54.35 
 
 
383 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  54.38 
 
 
391 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  52.77 
 
 
384 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  53.3 
 
 
384 aa  411  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  54.17 
 
 
384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  50.65 
 
 
385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  51.45 
 
 
384 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  51.04 
 
 
384 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  53.54 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  53.03 
 
 
394 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  53.03 
 
 
394 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  50 
 
 
388 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  50.4 
 
 
383 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  51.57 
 
 
398 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  53.56 
 
 
409 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  53.95 
 
 
387 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  50.66 
 
 
386 aa  364  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  52.36 
 
 
395 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  53.64 
 
 
395 aa  355  7.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  50.91 
 
 
397 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  51.85 
 
 
413 aa  346  5e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  51.98 
 
 
397 aa  346  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  49.07 
 
 
409 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
395 aa  341  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  49.61 
 
 
394 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  47.34 
 
 
385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  49.6 
 
 
382 aa  340  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
387 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 
381 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  45.6 
 
 
391 aa  332  8e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  48.81 
 
 
389 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  49.24 
 
 
397 aa  331  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  47.33 
 
 
384 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  46.75 
 
 
393 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  47.78 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  45.29 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  45.55 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.38 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  47.47 
 
 
400 aa  325  9e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  44 
 
 
389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  48.4 
 
 
401 aa  317  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  47.45 
 
 
387 aa  317  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  46.11 
 
 
389 aa  315  7e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  42.48 
 
 
386 aa  315  8e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  42.48 
 
 
386 aa  315  8e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  44.07 
 
 
393 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  43.8 
 
 
385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  42.22 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  42.48 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  42.48 
 
 
386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  42.48 
 
 
386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  42.48 
 
 
386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  49.6 
 
 
421 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  42.22 
 
 
386 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  44.53 
 
 
389 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  44.53 
 
 
389 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  43.01 
 
 
386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  43.27 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  44.65 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  41.95 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  43.19 
 
 
389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  44.21 
 
 
390 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.65 
 
 
387 aa  305  9.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  42.22 
 
 
385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  44.06 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  44.06 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  43.68 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  43.9 
 
 
390 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  42.37 
 
 
390 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  45.65 
 
 
397 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  43.31 
 
 
382 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  41.95 
 
 
386 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  41.69 
 
 
386 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  41.69 
 
 
386 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  41.95 
 
 
389 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  41.95 
 
 
386 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  43.16 
 
 
390 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  41.95 
 
 
386 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  43.16 
 
 
390 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  43.16 
 
 
390 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  43.42 
 
 
390 aa  299  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  43.8 
 
 
399 aa  299  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.89 
 
 
390 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  41.69 
 
 
389 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  42.11 
 
 
382 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  41.42 
 
 
386 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  41.42 
 
 
386 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  41.69 
 
 
382 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.17 
 
 
413 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  44 
 
 
384 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  44 
 
 
391 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  44 
 
 
391 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>