More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1414 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 413 aa  810    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  66.67 
 
 		 401 aa  465  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.95 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  60.46 
 
 		 394 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  64.21 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  61.52 
 
 		 409 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  62.5 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  55.96 
 
 		 391 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  61.72 
 
 		 381 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  56.22 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  61.22 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  57.47 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  60.93 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  57.92 
 
 		 382 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  64.46 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  56.99 
 
 		 389 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  56.99 
 
 		 389 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  55.06 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  55.06 
 
 		 384 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  56.67 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.12 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  59.17 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.59 
 
 		 385 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.33 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.69 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  55.87 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  55.24 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  55.5 
 
 		 391 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  58.21 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.35 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  52.56 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  51.85 
 
 		 392 aa  359  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 		 389 aa  355  8.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  51.86 
 
 		 397 aa  345  7e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  53.19 
 
 		 388 aa  342  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  50.4 
 
 		 383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  44.13 
 
 		 387 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  44.27 
 
 		 379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  50.13 
 
 		 417 aa  319  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  49.6 
 
 		 384 aa  315  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  47.09 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  41.94 
 
 		 400 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  46.35 
 
 		 397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  46.85 
 
 		 395 aa  308  8e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  48.81 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  47.35 
 
 		 394 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  45.48 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  46.01 
 
 		 394 aa  306  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  46.83 
 
 		 394 aa  305  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  44.12 
 
 		 384 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  40.62 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  46.3 
 
 		 388 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  43.58 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  46.79 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  43.32 
 
 		 384 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  46.15 
 
 		 395 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  46.52 
 
 		 409 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  43.05 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  41.15 
 
 		 386 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  41.15 
 
 		 386 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  46.44 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  45.72 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  41.15 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  42.25 
 
 		 385 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  40.89 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  41.15 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  41.15 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  41.15 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  43.88 
 
 		 391 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  40.62 
 
 		 386 aa  289  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  42.97 
 
 		 388 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  44.27 
 
 		 389 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  43.73 
 
 		 390 aa  286  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  38.01 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  45.81 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  43.48 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  43.48 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  43.48 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  43.48 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  45.29 
 
 		 421 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  43.48 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  43.48 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  42.28 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  43.65 
 
 		 400 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  43.22 
 
 		 384 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  44.95 
 
 		 405 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  46.26 
 
 		 398 aa  282  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  41.15 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  41.24 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  40.94 
 
 		 385 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  42.97 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  42.97 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  43.22 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  41.41 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  40.92 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  42.08 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  43.07 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.46 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  42.01 
 
 		 383 aa  275  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  40.36 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>