More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0835 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  100 
 
 
400 aa  803    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  68.17 
 
 
381 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  65.01 
 
 
394 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  64.25 
 
 
387 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.74 
 
 
387 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  62.44 
 
 
391 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  62.8 
 
 
382 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  63.71 
 
 
389 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  61.98 
 
 
391 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  62.83 
 
 
384 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  61.34 
 
 
391 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  63.97 
 
 
389 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  63.97 
 
 
389 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  63.75 
 
 
397 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  59.48 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  60.42 
 
 
397 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  59.64 
 
 
397 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.01 
 
 
385 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  59.84 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  56.59 
 
 
413 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  55.5 
 
 
389 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  61.74 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  59.52 
 
 
401 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  54.43 
 
 
386 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.88 
 
 
413 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  57.47 
 
 
395 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  58.64 
 
 
421 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  54.52 
 
 
409 aa  363  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.39 
 
 
387 aa  358  9e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  50.52 
 
 
389 aa  338  7e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.06 
 
 
402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  50.54 
 
 
397 aa  327  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  46.72 
 
 
387 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  47.47 
 
 
392 aa  325  9e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  49.07 
 
 
408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  47.2 
 
 
383 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  47.09 
 
 
395 aa  312  7.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  46.92 
 
 
395 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  48.03 
 
 
388 aa  306  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  46.86 
 
 
397 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  47.73 
 
 
384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  47.33 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  45.14 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  42.19 
 
 
382 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  42.86 
 
 
391 aa  299  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  44.09 
 
 
400 aa  296  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  45.18 
 
 
409 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  43.43 
 
 
387 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  43.97 
 
 
384 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  42.9 
 
 
384 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  44.8 
 
 
388 aa  292  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  43.16 
 
 
384 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  42.78 
 
 
382 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  43.68 
 
 
389 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  46.52 
 
 
383 aa  290  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  41.53 
 
 
383 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  40.1 
 
 
391 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  44.33 
 
 
417 aa  287  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  42.64 
 
 
391 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  42.64 
 
 
384 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  41.3 
 
 
382 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  42.64 
 
 
390 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  41.53 
 
 
383 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  42.64 
 
 
391 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  42.64 
 
 
391 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  41.3 
 
 
382 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  42.64 
 
 
391 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  42.64 
 
 
391 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  41.41 
 
 
388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  42.09 
 
 
385 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  42.38 
 
 
384 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  41.1 
 
 
390 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  47.18 
 
 
391 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  40.1 
 
 
382 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  40.62 
 
 
382 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  40.67 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  40.31 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  39.06 
 
 
382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  40.84 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  40.84 
 
 
390 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  45.31 
 
 
394 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  41.21 
 
 
399 aa  282  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  38.8 
 
 
382 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  44.61 
 
 
398 aa  282  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  43.97 
 
 
394 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  40.26 
 
 
390 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  45.04 
 
 
394 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  40.91 
 
 
393 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  40.1 
 
 
382 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  40.1 
 
 
382 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  40.84 
 
 
390 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  41.24 
 
 
390 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  40.36 
 
 
386 aa  279  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  40.84 
 
 
390 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  40.98 
 
 
390 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  40.84 
 
 
390 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  40.31 
 
 
390 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  43.28 
 
 
391 aa  276  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  41.09 
 
 
382 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  39.9 
 
 
385 aa  276  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>