More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2507 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  80.95 
 
 		 409 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 402 aa  812    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  56.8 
 
 		 386 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  58.12 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  57.18 
 
 		 387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  55.34 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  56.06 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.58 
 
 		 413 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  55.98 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  52.38 
 
 		 391 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  52.99 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  54.09 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  54.11 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.02 
 
 		 408 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.35 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.79 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  49.74 
 
 		 389 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  50 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  54.74 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  50.66 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.53 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  52.77 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  49.47 
 
 		 389 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  49.47 
 
 		 389 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  51.43 
 
 		 393 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  52.97 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  50.26 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  50.9 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  48.66 
 
 		 384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  51.06 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 389 aa  346  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  50.39 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  46.38 
 
 		 392 aa  339  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  49.73 
 
 		 397 aa  331  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  45.48 
 
 		 383 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  45.89 
 
 		 389 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  46.83 
 
 		 384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  46.97 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  45.12 
 
 		 388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  44.44 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  44.56 
 
 		 383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  42.78 
 
 		 387 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  44.83 
 
 		 379 aa  299  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  43.58 
 
 		 384 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  42.25 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  45.48 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  44.8 
 
 		 391 aa  296  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  42.4 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  41.98 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  41.49 
 
 		 385 aa  292  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  44.92 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  44.39 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  43.64 
 
 		 397 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  40 
 
 		 390 aa  288  8e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  41.07 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  41.07 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  41.07 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  44.35 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  41.33 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  41.07 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  41.07 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  41.07 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  42.97 
 
 		 391 aa  285  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  40.53 
 
 		 386 aa  285  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  42.63 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  41.44 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  43.73 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  42.74 
 
 		 421 aa  282  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  43.49 
 
 		 405 aa  282  7.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  42.13 
 
 		 400 aa  282  8.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  43.05 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  44.62 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  44.35 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  40.69 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 386 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  40.16 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  39.36 
 
 		 386 aa  276  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  38.83 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  39.04 
 
 		 386 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  39.04 
 
 		 386 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  38.83 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  38.77 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  36.94 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  39.2 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  41.41 
 
 		 382 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  41.37 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0220  aminotransferase class I and II  39.01 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  40.85 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  39.68 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  40.69 
 
 		 389 aa  263  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  39.15 
 
 		 391 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  39.15 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  41.41 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  41.41 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  41.41 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  41.41 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>