More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2011 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  100 
 
 		 399 aa  817    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  81.43 
 
 		 390 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  82.01 
 
 		 390 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  92.01 
 
 		 390 aa  751    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  80.37 
 
 		 390 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  80.78 
 
 		 389 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  79.49 
 
 		 390 aa  634    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  81.7 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  91.75 
 
 		 390 aa  746    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  81.17 
 
 		 390 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  80.37 
 
 		 390 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  80.11 
 
 		 390 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  81.17 
 
 		 390 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  80.37 
 
 		 390 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  80.37 
 
 		 390 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  79.79 
 
 		 390 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  78.72 
 
 		 391 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  78.72 
 
 		 384 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  78.72 
 
 		 391 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  78.72 
 
 		 391 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  78.72 
 
 		 391 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  78.72 
 
 		 391 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  78.46 
 
 		 384 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  73.67 
 
 		 386 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  72.3 
 
 		 391 aa  574  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  72.03 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  71.35 
 
 		 383 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  71.62 
 
 		 383 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  70.82 
 
 		 391 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  70.29 
 
 		 388 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  69.5 
 
 		 389 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  65.16 
 
 		 393 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  65.81 
 
 		 399 aa  531  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  66.75 
 
 		 400 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2600  aminotransferase class I and II  69.29 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.492563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3291  putative aminotransferase  65.26 
 
 		 385 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  60 
 
 		 385 aa  464  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2698  putative aminotransferase  58.16 
 
 		 382 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  52.37 
 
 		 413 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2072  aminotransferase class I and II  52.93 
 
 		 381 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0778  aminotransferase class I and II  54.52 
 
 		 380 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06061  putative aminotransferase  58.45 
 
 		 373 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0129479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00866  putative aminotransferase  58.45 
 
 		 373 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  57.71 
 
 		 382 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  57.45 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  56.65 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  56.91 
 
 		 382 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  57.18 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  57.45 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1559  putative aminotransferase  55.56 
 
 		 410 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000413042  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  57.52 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  56.91 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  57.71 
 
 		 382 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  55.85 
 
 		 382 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1616  putative aminotransferase  54.76 
 
 		 410 aa  413  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  52.28 
 
 		 384 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  52.13 
 
 		 384 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  53.3 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  53.03 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  55.59 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  53.3 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  53.03 
 
 		 386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  51.95 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  53.03 
 
 		 386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  53.3 
 
 		 386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  53.03 
 
 		 386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  50.53 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  52.24 
 
 		 386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0220  aminotransferase class I and II  51.85 
 
 		 385 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  52.77 
 
 		 386 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  52.77 
 
 		 386 aa  405  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  51.06 
 
 		 384 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  52.77 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  51.72 
 
 		 385 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0118  putative aminotransferase  52.12 
 
 		 384 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  51.72 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  51.06 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0133  putative aminotransferase  51.85 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3299  putative aminotransferase  51.32 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  51.72 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  51.45 
 
 		 386 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  51.72 
 
 		 386 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  50.53 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04720  putative aminotransferase  47.07 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291343  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2936  putative aminotransferase  51.59 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0109  putative aminotransferase  51.06 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  51.85 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  51.72 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  51.72 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  51.72 
 
 		 389 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  51.45 
 
 		 386 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0157  putative aminotransferase  50.79 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  50.92 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2834  aminotransferase class I and II  53.07 
 
 		 386 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4026  putative aminotransferase  50.79 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  49.07 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3295  putative aminotransferase  50 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3032  putative aminotransferase  50.53 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3339  putative aminotransferase  50.53 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1570  putative aminotransferase  50.53 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>