More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4133 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 395 aa  800    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  86.8 
 
 		 395 aa  686    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  63.61 
 
 		 397 aa  482  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  55.33 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  52.36 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 		 389 aa  352  8.999999999999999e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  50.53 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  52.52 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  49.1 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  47.69 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  47.93 
 
 		 385 aa  338  9e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  49.62 
 
 		 387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  49.48 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  51.15 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  45.74 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  45.99 
 
 		 384 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  45.22 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  47.97 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  47.83 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  50.13 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  48.7 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  47.75 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  44.13 
 
 		 384 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 		 382 aa  326  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  46.68 
 
 		 421 aa  325  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  46.89 
 
 		 383 aa  324  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  42.28 
 
 		 393 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  43.62 
 
 		 384 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  47.45 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  46.53 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  47.88 
 
 		 383 aa  323  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  49.1 
 
 		 388 aa  322  5e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  48.56 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  44.01 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  49.87 
 
 		 387 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  47.48 
 
 		 394 aa  319  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  46.11 
 
 		 384 aa  319  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  45.78 
 
 		 389 aa  319  7e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  44.01 
 
 		 399 aa  318  9e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  48.41 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  46.92 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  47.48 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  44.27 
 
 		 385 aa  316  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  43.49 
 
 		 390 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  47.53 
 
 		 384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  44.27 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  48.81 
 
 		 398 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  44.1 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  44.1 
 
 		 383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  42.05 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  46.61 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  46.43 
 
 		 391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  44.27 
 
 		 390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  43.33 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  46.85 
 
 		 413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  44.53 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  43.49 
 
 		 388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  42.97 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  44.01 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  42.49 
 
 		 379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  42.97 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  44.53 
 
 		 390 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  43.49 
 
 		 390 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  42.97 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  43.59 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  43.59 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  43.59 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  43.59 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  43.75 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  43.59 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  43.59 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  42.97 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  42.97 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  44.1 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  42.97 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  43.75 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  43.75 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  42.97 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  43.73 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  44.25 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.48 
 
 		 387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  46.39 
 
 		 409 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  46.58 
 
 		 391 aa  302  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.85 
 
 		 387 aa  302  7.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0220  aminotransferase class I and II  43.37 
 
 		 385 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  42.45 
 
 		 386 aa  301  9e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  42.19 
 
 		 385 aa  302  9e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  41.46 
 
 		 399 aa  301  9e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  43.15 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  42.82 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  42.74 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  42.74 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  42.45 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  43.75 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  38.11 
 
 		 390 aa  298  8e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  41.22 
 
 		 391 aa  298  9e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  41.93 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  42.71 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.48 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>