More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3813 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  100 
 
 		 405 aa  820    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  80.76 
 
 		 421 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  56.04 
 
 		 393 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  59.69 
 
 		 379 aa  442  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  52.94 
 
 		 400 aa  408  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  54.33 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  49.1 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  46.29 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  45.6 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  50 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  47.83 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  43.73 
 
 		 389 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  45.9 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  45.29 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  46.65 
 
 		 386 aa  308  8e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  43.56 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.67 
 
 		 387 aa  293  5e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  45.03 
 
 		 390 aa  293  5e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  44.71 
 
 		 409 aa  292  9e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  42.6 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  43.95 
 
 		 389 aa  286  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  44.04 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  41.78 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  43.65 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  43.49 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  44.91 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  41.01 
 
 		 388 aa  279  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  43.12 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.51 
 
 		 385 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  42.3 
 
 		 393 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  44.07 
 
 		 397 aa  275  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  40.84 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  44.9 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  40.89 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  42.08 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  40.21 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  38.58 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  39.69 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  37.85 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  38.58 
 
 		 385 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  41.25 
 
 		 388 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  42.97 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  39.69 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  41.55 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 390 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  37.17 
 
 		 384 aa  266  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  40 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  40.16 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  40.32 
 
 		 392 aa  265  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0778  aminotransferase class I and II  36.73 
 
 		 380 aa  266  7e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.13 
 
 		 387 aa  265  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 386 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  38.62 
 
 		 386 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  39.74 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  38.12 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  39.43 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 390 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  39.73 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  38.62 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  38.32 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  41.53 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  39.33 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  38.36 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  40.44 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 386 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  37.8 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  38.07 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  38.01 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  38.07 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  37.7 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  40.21 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  39.89 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  39.95 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  39.69 
 
 		 390 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  37.8 
 
 		 386 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  37.01 
 
 		 382 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  40.43 
 
 		 383 aa  259  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  38.82 
 
 		 390 aa  259  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  39.18 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  41.05 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  38.76 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  39.18 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  39.18 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  36.75 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  39.18 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  39.18 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  39.18 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  39.46 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  38.92 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  38.58 
 
 		 394 aa  255  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  37.53 
 
 		 386 aa  255  9e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  38.22 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  37.63 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>