More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09980 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 387 aa  778    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  57.69 
 
 		 413 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  53.83 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  54.26 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  54.26 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  51.72 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  51.19 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  51.03 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  51.96 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  50.77 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  50.79 
 
 		 409 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  52.36 
 
 		 382 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.53 
 
 		 402 aa  359  6e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  50.39 
 
 		 400 aa  358  8e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  53.05 
 
 		 401 aa  355  7.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.39 
 
 		 385 aa  355  8.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  51.05 
 
 		 387 aa  354  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  48.7 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  52.77 
 
 		 381 aa  351  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.97 
 
 		 387 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  53.54 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  52.58 
 
 		 395 aa  346  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  48.7 
 
 		 391 aa  345  7e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  48.96 
 
 		 391 aa  342  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.71 
 
 		 408 aa  339  5.9999999999999996e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  48.7 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  48.7 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  48.94 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.4 
 
 		 413 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  46.91 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  50.53 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  47.33 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  47.2 
 
 		 397 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  46.54 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  47.43 
 
 		 383 aa  309  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  46.76 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  45.65 
 
 		 392 aa  305  9.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  44.39 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  45.6 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  43.48 
 
 		 387 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  44.85 
 
 		 395 aa  299  7e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  46.93 
 
 		 384 aa  298  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  43.04 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  44.97 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  46.3 
 
 		 417 aa  295  8e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  46.24 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  46.07 
 
 		 384 aa  292  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  42.12 
 
 		 385 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  45.8 
 
 		 383 aa  292  6e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  40.96 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  44.53 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  44.72 
 
 		 409 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  43.43 
 
 		 397 aa  288  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  42.12 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  42.12 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  40.94 
 
 		 390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  39.74 
 
 		 400 aa  285  5.999999999999999e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  43.11 
 
 		 391 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  43.11 
 
 		 391 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  43.11 
 
 		 391 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  43.11 
 
 		 391 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  43.11 
 
 		 391 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  43.68 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  42.86 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  44.2 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  43.42 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  40.68 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  37.14 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  41.47 
 
 		 399 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  42.29 
 
 		 396 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  42.67 
 
 		 405 aa  282  6.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  42.44 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.44 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  42.15 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  41.88 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  42.13 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  41.85 
 
 		 394 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  41.47 
 
 		 389 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  42.18 
 
 		 390 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  42.18 
 
 		 390 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  42.4 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  42.86 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  40.47 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  43.67 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  44.89 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  40.69 
 
 		 385 aa  276  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  38.54 
 
 		 386 aa  276  6e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  40.16 
 
 		 385 aa  276  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  38.54 
 
 		 386 aa  276  6e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  40.42 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  42.18 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  38.8 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  41.56 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  38.54 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  38.54 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  38.54 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  42.16 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  38.8 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>