More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3904 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  100 
 
 
387 aa  800    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  56.22 
 
 
397 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  55.33 
 
 
395 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  53.54 
 
 
395 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  50.52 
 
 
389 aa  361  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  46.52 
 
 
393 aa  354  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.87 
 
 
385 aa  352  8.999999999999999e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  46.05 
 
 
379 aa  351  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  48.68 
 
 
394 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  45.09 
 
 
385 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  46.72 
 
 
383 aa  346  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  46.72 
 
 
388 aa  345  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  46.72 
 
 
383 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  44.76 
 
 
397 aa  345  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  44.56 
 
 
386 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  44.18 
 
 
384 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  46.19 
 
 
386 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  44.56 
 
 
386 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  46.46 
 
 
393 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  44.83 
 
 
386 aa  342  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  42.82 
 
 
400 aa  342  8e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  44.3 
 
 
386 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  44.3 
 
 
386 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  44.3 
 
 
386 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  44.3 
 
 
386 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  44.3 
 
 
386 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  46.81 
 
 
386 aa  341  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  44.3 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  44.3 
 
 
385 aa  340  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  44.03 
 
 
386 aa  339  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  45.99 
 
 
421 aa  339  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  48.83 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  45.36 
 
 
389 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  43.77 
 
 
385 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  43.77 
 
 
386 aa  336  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  46.04 
 
 
395 aa  335  9e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  45.93 
 
 
390 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  46.19 
 
 
391 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  46.19 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  41.04 
 
 
390 aa  333  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  46.19 
 
 
391 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  46.19 
 
 
391 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  48.44 
 
 
397 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  46.19 
 
 
391 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  46.19 
 
 
391 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  45.89 
 
 
399 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  46.19 
 
 
384 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  45.14 
 
 
390 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  45.62 
 
 
390 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0778  aminotransferase class I and II  45.09 
 
 
380 aa  332  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  44.53 
 
 
391 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  44.03 
 
 
385 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  43.77 
 
 
386 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  45.36 
 
 
390 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  44.62 
 
 
386 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  45.36 
 
 
391 aa  330  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  44.62 
 
 
386 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  45.65 
 
 
381 aa  329  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  44.62 
 
 
389 aa  328  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  45.14 
 
 
390 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  45.6 
 
 
405 aa  328  8e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  44.62 
 
 
386 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  45.29 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  44.88 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  44.88 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  44.73 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  44.79 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  46.72 
 
 
400 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  44.36 
 
 
389 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  42.71 
 
 
386 aa  326  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  44.76 
 
 
390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  44.62 
 
 
390 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  44.76 
 
 
390 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  44.59 
 
 
383 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.71 
 
 
387 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  44.76 
 
 
384 aa  322  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  43.77 
 
 
396 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  45.21 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  42.89 
 
 
389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  43.77 
 
 
399 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  43.31 
 
 
390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  45.34 
 
 
391 aa  319  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  43.31 
 
 
390 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  40.57 
 
 
393 aa  319  6e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  46.72 
 
 
388 aa  318  7.999999999999999e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.06 
 
 
413 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  44.27 
 
 
391 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  45.82 
 
 
397 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  43.92 
 
 
387 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  44.83 
 
 
382 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  45.95 
 
 
401 aa  316  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  42.11 
 
 
384 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  42.67 
 
 
393 aa  316  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  44.33 
 
 
383 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  43.24 
 
 
389 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  42.59 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  43.77 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  43.86 
 
 
382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  43.56 
 
 
389 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  42.55 
 
 
382 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>