More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0778 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0778  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 380 aa  798    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2072  aminotransferase class I and II  57.71 
 
 		 381 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  56.61 
 
 		 396 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  56.35 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  55.29 
 
 		 384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  55.82 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  55.29 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  55.29 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  55.29 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  55.82 
 
 		 390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  55.56 
 
 		 390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  56.08 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  55.56 
 
 		 390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  55.29 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  55.29 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  55.03 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  55.82 
 
 		 390 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  55.03 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  55.15 
 
 		 383 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  55.15 
 
 		 383 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  56.38 
 
 		 390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  55.29 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  54.76 
 
 		 390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  55.32 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  55.85 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  53.72 
 
 		 389 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  54.64 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  54.52 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  53.6 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  53.85 
 
 		 390 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  49.88 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  52.65 
 
 		 386 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  53.72 
 
 		 389 aa  424  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0694  2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  51.72 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.519768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  51.85 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2834  aminotransferase class I and II  53.72 
 
 		 386 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3291  putative aminotransferase  53.35 
 
 		 385 aa  415  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0133  putative aminotransferase  50.53 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  50.8 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  52.51 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  52.82 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3299  putative aminotransferase  50 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2936  putative aminotransferase  50.27 
 
 		 384 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0109  putative aminotransferase  50 
 
 		 384 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04720  putative aminotransferase  52.13 
 
 		 381 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  50.27 
 
 		 384 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  51.98 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  49.2 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  49.73 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0118  putative aminotransferase  49.73 
 
 		 384 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  51.46 
 
 		 400 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  48.94 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  51.19 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  52.24 
 
 		 382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  51.98 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  48.95 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  51.72 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  51.32 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  48.94 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2490  putative aminotransferase  47.35 
 
 		 391 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  48.15 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  51.72 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  49.6 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  51.86 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3295  putative aminotransferase  47.34 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  49.34 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3032  putative aminotransferase  48.53 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  49.07 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2971  putative aminotransferase  48.53 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3953  putative aminotransferase  48.79 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0157  putative aminotransferase  48.79 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  50.4 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2698  putative aminotransferase  50 
 
 		 382 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4026  putative aminotransferase  48.79 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3339  putative aminotransferase  48.53 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1570  putative aminotransferase  48.53 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  48.81 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  48.54 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  49.07 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  48.81 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  48.54 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  48.54 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  48.54 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  49.07 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  49.34 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  49.34 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  48.81 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  48.28 
 
 		 386 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  49.07 
 
 		 385 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  49.34 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  48.81 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  48.54 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  48.54 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  48.28 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00866  putative aminotransferase  48.26 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  48.28 
 
 		 386 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  48.28 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  48.28 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06061  putative aminotransferase  48.26 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0129479  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1559  putative aminotransferase  46.86 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000413042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>