More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13700 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
413 aa  823    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  64.86 
 
 
401 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  66.18 
 
 
421 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  63.95 
 
 
413 aa  462  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  65 
 
 
402 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  56.23 
 
 
409 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  58.53 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.56 
 
 
408 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  59.68 
 
 
382 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  60.69 
 
 
387 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.62 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  56.88 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.58 
 
 
402 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  56.43 
 
 
381 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.26 
 
 
385 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  52.49 
 
 
391 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  53.44 
 
 
393 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  55.67 
 
 
397 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  56.02 
 
 
397 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  55.09 
 
 
395 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  52.82 
 
 
397 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  51.45 
 
 
389 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  53.44 
 
 
386 aa  368  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  55.82 
 
 
387 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  52.77 
 
 
384 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  52.24 
 
 
389 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  52.24 
 
 
389 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  51.31 
 
 
391 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  52.23 
 
 
391 aa  365  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.4 
 
 
387 aa  344  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  50.39 
 
 
389 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  45.06 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  46.19 
 
 
417 aa  321  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  48.96 
 
 
397 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  45.17 
 
 
392 aa  305  9.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  43.04 
 
 
384 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  42.26 
 
 
387 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  44.85 
 
 
383 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  43.28 
 
 
397 aa  296  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  44.53 
 
 
384 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  45.09 
 
 
383 aa  294  2e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  46.21 
 
 
383 aa  293  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  44.88 
 
 
384 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  46.32 
 
 
395 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  45.95 
 
 
388 aa  288  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  40.42 
 
 
384 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  40.16 
 
 
384 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  39.9 
 
 
385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  44.3 
 
 
400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  44.59 
 
 
391 aa  282  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  43.85 
 
 
395 aa  279  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  40.16 
 
 
379 aa  276  6e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  43.01 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  43.5 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  43.65 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  39.02 
 
 
393 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  39.53 
 
 
390 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  44.36 
 
 
391 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  41.36 
 
 
394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  39.53 
 
 
390 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  42.33 
 
 
394 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  38.46 
 
 
400 aa  265  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  38.74 
 
 
390 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  42.06 
 
 
394 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  39.95 
 
 
382 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  39.58 
 
 
382 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  39.35 
 
 
391 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  39.35 
 
 
391 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  39.35 
 
 
391 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  39.95 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  39.95 
 
 
391 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  39.95 
 
 
391 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  38.74 
 
 
390 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  39.69 
 
 
390 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  43.57 
 
 
383 aa  262  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  39.69 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  38.74 
 
 
390 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  38.74 
 
 
390 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  40.53 
 
 
389 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  39.32 
 
 
382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  38.48 
 
 
390 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  38.36 
 
 
385 aa  259  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  39.69 
 
 
382 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  40.84 
 
 
385 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  38.1 
 
 
385 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  38.42 
 
 
388 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  37.2 
 
 
397 aa  256  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  37.5 
 
 
382 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  39.01 
 
 
390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  39.45 
 
 
413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  38.22 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  37.43 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  37.83 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  37.83 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  38.85 
 
 
399 aa  254  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  37.76 
 
 
382 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  37.7 
 
 
390 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  38.54 
 
 
382 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  37.27 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>