More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4251 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  100 
 
 
397 aa  800    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  89.42 
 
 
397 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  64.87 
 
 
394 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  65.89 
 
 
387 aa  484  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  65.36 
 
 
382 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  65.03 
 
 
387 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  60.68 
 
 
384 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  62.95 
 
 
391 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  60.42 
 
 
400 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  64.75 
 
 
381 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.54 
 
 
385 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  60.78 
 
 
393 aa  448  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.18 
 
 
387 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  63.33 
 
 
395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  62.47 
 
 
413 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  59.22 
 
 
386 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  61.74 
 
 
401 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  56.62 
 
 
389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  54.73 
 
 
391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  56.35 
 
 
397 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  55.64 
 
 
391 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.4 
 
 
387 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  53.61 
 
 
389 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  54.69 
 
 
389 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  59.63 
 
 
402 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  54.47 
 
 
409 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.02 
 
 
413 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  54.38 
 
 
389 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  54.38 
 
 
389 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  59.01 
 
 
421 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  54.96 
 
 
397 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  54.4 
 
 
388 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  51.98 
 
 
392 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.97 
 
 
402 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  48.83 
 
 
387 aa  359  4e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  51.32 
 
 
383 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  51.15 
 
 
395 aa  349  6e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  51.19 
 
 
395 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  51.99 
 
 
384 aa  346  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  51.44 
 
 
397 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  49.47 
 
 
394 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  46.79 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  48.39 
 
 
394 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  49.47 
 
 
408 aa  323  4e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  47.21 
 
 
388 aa  322  9.000000000000001e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  48.66 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  48.12 
 
 
394 aa  318  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  47.98 
 
 
409 aa  316  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  48.4 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  44.92 
 
 
384 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  49.2 
 
 
391 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  47.04 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  44.39 
 
 
384 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  46.13 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  41.13 
 
 
386 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  41.13 
 
 
386 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  43.58 
 
 
384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  41.13 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  41.13 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  45.34 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  41.13 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  42.78 
 
 
385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  48.28 
 
 
383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  45.15 
 
 
400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  44.96 
 
 
421 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  41.13 
 
 
386 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  41.67 
 
 
393 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  46.26 
 
 
384 aa  301  9e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  45.08 
 
 
391 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  45.08 
 
 
391 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  45.08 
 
 
384 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  45.08 
 
 
391 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  45.08 
 
 
391 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  45.08 
 
 
391 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  40.62 
 
 
386 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  44.82 
 
 
384 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  40.62 
 
 
386 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  43.67 
 
 
390 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  43.64 
 
 
389 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  43.5 
 
 
383 aa  294  2e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  43.01 
 
 
391 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  40 
 
 
390 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  41.45 
 
 
394 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  42.3 
 
 
385 aa  293  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  42.04 
 
 
385 aa  292  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  40.85 
 
 
386 aa  292  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  40.85 
 
 
386 aa  292  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  40.67 
 
 
391 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  42.67 
 
 
399 aa  289  6e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  43.15 
 
 
390 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  40.46 
 
 
386 aa  288  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  43.15 
 
 
390 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  44.41 
 
 
417 aa  288  9e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  41.13 
 
 
389 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  41.73 
 
 
383 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  40.99 
 
 
379 aa  288  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  40.21 
 
 
385 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  42.04 
 
 
388 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  41.9 
 
 
390 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  43.4 
 
 
390 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>