More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1935 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 383 aa  763    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  45.14 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  45.45 
 
 		 389 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  45.82 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  45.43 
 
 		 387 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  44.77 
 
 		 381 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.14 
 
 		 385 aa  292  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  45.74 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  45.74 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  44.95 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  42.67 
 
 		 393 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  44.21 
 
 		 391 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  43.27 
 
 		 394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  42.4 
 
 		 391 aa  286  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.09 
 
 		 413 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  44.53 
 
 		 397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  43.24 
 
 		 384 aa  282  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  42.82 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.86 
 
 		 387 aa  280  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.86 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  40.43 
 
 		 382 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  44.65 
 
 		 401 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  45.16 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  41.8 
 
 		 409 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  45.91 
 
 		 421 aa  275  9e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  45.81 
 
 		 413 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  42.55 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  41.55 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  43.5 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  46.15 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  41.55 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  42.82 
 
 		 389 aa  270  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  42.44 
 
 		 397 aa  269  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  39.25 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  40.16 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  40.16 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  39.89 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  40.37 
 
 		 387 aa  265  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  39.37 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  40.86 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  42.44 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  39.52 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  39.25 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  39.11 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  39.11 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  40.97 
 
 		 382 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  40.97 
 
 		 382 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  38.98 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0118  putative aminotransferase  40.05 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  43.46 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  41.01 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0109  putative aminotransferase  40.05 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  39.52 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  40.8 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2490  putative aminotransferase  38.1 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  40.53 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  37.74 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  37.63 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  41.84 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  39.3 
 
 		 390 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  39.04 
 
 		 396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  39.52 
 
 		 384 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  42.16 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3295  putative aminotransferase  39.52 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  38.58 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0133  putative aminotransferase  39.52 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.68 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  41.22 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  39.04 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  39.04 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  39.04 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  39.04 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  39.04 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  39.04 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  39.89 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  39.25 
 
 		 384 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1559  putative aminotransferase  40.86 
 
 		 410 aa  255  8e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000413042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  37.8 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  37.23 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  38.77 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  36.64 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  38.5 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2936  putative aminotransferase  39.25 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1616  putative aminotransferase  41.13 
 
 		 410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3299  putative aminotransferase  38.71 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  38.24 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  43.21 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  38.24 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  42.02 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  36.64 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  41.78 
 
 		 388 aa  252  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  39.57 
 
 		 387 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  40.32 
 
 		 391 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  38.5 
 
 		 399 aa  252  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4026  putative aminotransferase  40.38 
 
 		 384 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0157  putative aminotransferase  40.38 
 
 		 384 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>