More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2956 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  100 
 
 
387 aa  780    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  76.68 
 
 
394 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  75.99 
 
 
382 aa  568  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  69.69 
 
 
393 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  68.22 
 
 
391 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  64.25 
 
 
400 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.86 
 
 
387 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  65.89 
 
 
397 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  65.63 
 
 
397 aa  472  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  64.47 
 
 
381 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  62.24 
 
 
387 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.01 
 
 
385 aa  432  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  57.22 
 
 
384 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  54.66 
 
 
391 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  54.92 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  59.17 
 
 
413 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  58.61 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  56.69 
 
 
389 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  55.13 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  55.32 
 
 
386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  55.18 
 
 
389 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  55.18 
 
 
389 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  53.51 
 
 
391 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.69 
 
 
413 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  58.68 
 
 
401 aa  398  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  56.08 
 
 
409 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  58.22 
 
 
421 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.96 
 
 
387 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  57.94 
 
 
402 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  53 
 
 
389 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.77 
 
 
402 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  52 
 
 
397 aa  347  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
392 aa  343  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  48.13 
 
 
383 aa  338  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  49.62 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  50.26 
 
 
388 aa  335  7e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  49.61 
 
 
395 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  47.35 
 
 
388 aa  331  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  44.89 
 
 
387 aa  322  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  44.89 
 
 
384 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.4 
 
 
408 aa  321  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  45.16 
 
 
384 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  47.45 
 
 
384 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  48.93 
 
 
417 aa  319  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  44.62 
 
 
384 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  43.95 
 
 
387 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  47.15 
 
 
397 aa  316  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  44.2 
 
 
385 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  46.9 
 
 
384 aa  312  7.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  41.1 
 
 
393 aa  309  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  47.86 
 
 
383 aa  305  7e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  46.26 
 
 
394 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  46.4 
 
 
383 aa  305  8.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  45.7 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  45.43 
 
 
383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  46.26 
 
 
394 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  46.15 
 
 
409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  46.93 
 
 
394 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  41.56 
 
 
382 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  42.86 
 
 
382 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  41.42 
 
 
397 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  44.76 
 
 
400 aa  285  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  40.31 
 
 
382 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  40.21 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  40.21 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  41.1 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  40.36 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  44.92 
 
 
398 aa  282  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  39.43 
 
 
382 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  41.1 
 
 
382 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  42.74 
 
 
391 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  43.23 
 
 
421 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  40.89 
 
 
390 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  40.42 
 
 
400 aa  280  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  40.89 
 
 
390 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  41.41 
 
 
399 aa  278  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  39.74 
 
 
385 aa  278  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  40.78 
 
 
382 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  39.43 
 
 
385 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  40.89 
 
 
390 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  40.37 
 
 
379 aa  276  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  43.12 
 
 
405 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  41.69 
 
 
385 aa  276  6e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  39.74 
 
 
386 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  39.74 
 
 
386 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  39.47 
 
 
385 aa  275  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  39.43 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  40 
 
 
389 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  44.3 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  40.67 
 
 
391 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  40.31 
 
 
383 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  40.31 
 
 
383 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  41.19 
 
 
390 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  38.67 
 
 
384 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  39.31 
 
 
386 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  41.93 
 
 
389 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  39.47 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  40.16 
 
 
390 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  39.01 
 
 
413 aa  269  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  38.56 
 
 
399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>