More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2517 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  90.54 
 
 		 394 aa  706    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  795    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  97.97 
 
 		 394 aa  766    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  77.51 
 
 		 383 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  76.72 
 
 		 384 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  73.71 
 
 		 409 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  64.47 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  68.89 
 
 		 398 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  64.46 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  65.07 
 
 		 384 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  64.02 
 
 		 385 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  68 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  64.53 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  66.05 
 
 		 384 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  64.19 
 
 		 383 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  61.27 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  58.75 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  53.03 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  56.44 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  54.91 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  53.05 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  50.8 
 
 		 391 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  49.74 
 
 		 391 aa  354  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  50 
 
 		 397 aa  332  8e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  51.61 
 
 		 389 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  46.38 
 
 		 386 aa  322  7e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  47.48 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  48.28 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  47.62 
 
 		 394 aa  315  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  47.87 
 
 		 382 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  48.84 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  46.4 
 
 		 393 aa  308  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.68 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  45.38 
 
 		 395 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  43.9 
 
 		 386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  43.9 
 
 		 386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  42.28 
 
 		 387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  41.62 
 
 		 386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  49.07 
 
 		 397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  41.62 
 
 		 386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  44.97 
 
 		 384 aa  302  6.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  47.61 
 
 		 401 aa  302  8.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  47.35 
 
 		 413 aa  301  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  41.62 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  48.66 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  41.62 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  41.62 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.77 
 
 		 387 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  44.17 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  43.36 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  41.62 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  41.36 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  43.82 
 
 		 385 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  43.82 
 
 		 385 aa  299  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  46.56 
 
 		 381 aa  298  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  46.26 
 
 		 387 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  41.1 
 
 		 386 aa  297  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  42.63 
 
 		 385 aa  296  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  45.16 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  44.15 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  40.36 
 
 		 413 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  39.89 
 
 		 400 aa  292  6e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  41.67 
 
 		 385 aa  292  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  43.88 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  42.41 
 
 		 390 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  42.41 
 
 		 390 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  45.31 
 
 		 400 aa  288  9e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  43.85 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  43.01 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  42.2 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  43.01 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  41.04 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  42.01 
 
 		 390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.52 
 
 		 390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  41.04 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  43.36 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  41.46 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  42.74 
 
 		 383 aa  286  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  40.81 
 
 		 379 aa  286  5e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  41.04 
 
 		 386 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  41.04 
 
 		 389 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  41.73 
 
 		 390 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  42.97 
 
 		 388 aa  286  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  42.48 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  42.48 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  42.48 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  42.48 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  41.04 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  42.48 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  42.48 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  37.8 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  43.82 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  41.62 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  42.22 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  42.52 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  46.74 
 
 		 421 aa  283  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>