More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30130 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 408 aa  810    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.56 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  55.5 
 
 		 413 aa  398  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  53.12 
 
 		 409 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.02 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  54.25 
 
 		 401 aa  378  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.84 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  52.2 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.71 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  49.2 
 
 		 386 aa  352  7e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  48.56 
 
 		 391 aa  350  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  53.75 
 
 		 421 aa  349  5e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  53.39 
 
 		 402 aa  348  8e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.19 
 
 		 387 aa  345  7e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  50.93 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  51.71 
 
 		 382 aa  342  8e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  48.29 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  47.89 
 
 		 389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  49.07 
 
 		 400 aa  333  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  48.7 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  48.16 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  48.16 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  50.4 
 
 		 387 aa  328  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  47.27 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  47.48 
 
 		 384 aa  325  7e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  48.56 
 
 		 391 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  49.34 
 
 		 381 aa  324  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  48.95 
 
 		 397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  47.77 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  47.8 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  47.09 
 
 		 383 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  47.09 
 
 		 383 aa  311  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  45.5 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  46.95 
 
 		 389 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  47.87 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  44.44 
 
 		 394 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  46.02 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  46.86 
 
 		 384 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  43.39 
 
 		 387 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  46.84 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  42.59 
 
 		 385 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  42.59 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  42.59 
 
 		 384 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  44.97 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 392 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  44.18 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  42.44 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  45.24 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  39.05 
 
 		 397 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  40.21 
 
 		 379 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  44.97 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  42.93 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  39.37 
 
 		 400 aa  278  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  42.74 
 
 		 387 aa  276  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  43.12 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  43.85 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  41.8 
 
 		 383 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  43.38 
 
 		 391 aa  265  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  41.99 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  39.1 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  41.15 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  43.01 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  43.75 
 
 		 395 aa  256  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  38.42 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  41.95 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  40.94 
 
 		 421 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  35.79 
 
 		 393 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  39.42 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  38.58 
 
 		 386 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  41.51 
 
 		 384 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  39.42 
 
 		 390 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  40.68 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  39.68 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  39.68 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  39.15 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  39.15 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  38.2 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  39.42 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 		 413 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  38.36 
 
 		 390 aa  245  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  41.44 
 
 		 395 aa  245  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  38.73 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  39.42 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10257  predicted protein  38.52 
 
 		 459 aa  244  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.144929  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  36.01 
 
 		 385 aa  244  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  41.82 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  39.11 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  39.63 
 
 		 382 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  38.1 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  38.2 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  38.46 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  38.1 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>